En enero de 1968, realiza un ejercicio en el mar Mediterráneo. Después de completar con éxito nueve días de entrenamiento, deja en Toulon a un miembro de su tripulación en la noche del 26 al 27 de enero por un dolor de muelas… y zarpa de nuevo para un último día en el mar.	Es sólo por la noche, mientras se espera al Minerve a las 9 en el puerto de Toulon, que la escuadrilla empieza a preocuparse. Nadie tiene noticias del navío. Dan finalmente la alerta a las 2:15 de la madrugada. El presidente francés, Charles de Gaulle, y el entonces ministro de las Fuerzas Armadas, Pierre Messmer, son despertados. Empiezan las búsquedas con submarinos, aviones, helicópteros, buques militares y hasta el portaviones Clémenceau, cuyo personal es llamado con altavoces en las calles de la ciudad. El mini submarino del comandante Cousteau también presta asistencia.	A medida que pasan las horas, queda claro que el submarino ha sufrido un percance. La esperanza de encontrar a los marineros vivos dura poco: cinco días después de la tragedia, el 2 de febrero, se abandonan las búsquedas. Los medios técnicos de la época no permiten sondear los fondos muy profundos. Otras dos campañas de investigación se llevan a cabo en 1968 y 1969 sin más éxito, y la Marina termina clasificando el caso como “secreto militar”.	Menos de 15 días después del drama, el general de Gaulle efectuará una inmersión a bordo de un submarino similar, Eurydice, para demostrar que los navíos Daphné son seguros. Este submarino también se hundirá dos años después frente a las costas de Saint-Tropez, ocasionando la muerte de sus 57 tripulantes.