반란을 진압하고, 거리의 주도권을 샤리에파에게 되돌리기 위해 약 3만명의 공화국군이 리옹으로 파견되어 8월 8일 부터 리옹을 포위했다. 리옹은 도시의 주위를 성벽으로 감싼 요새도시 였으나, 공화국군은 대포를 사용하여 직접 시내에 포탄을 퍼부어 도시를 파괴했다.

곧 시내에서 샤리에파가 린치에 당하고 있다는 정보가 입수되자, 이들을 구출하기 위해 공화국군은 리옹에 대해 철저히 포격을 가하고 거리를 침묵시켰다. 이 때 프랑스에서는 징병제가 시작되었으며, 공화국군이 쉽게 인원을 보충 수 있었던 것도, 리옹에게는 불리하게 작용했다. 10월 9일, 리옹은 혁명 정부에 휴전을 제의하고 성문을 연다.

또한 이 포위는 나중에 대륙군 사령관이 되는 루이 가브리엘 쉬셰도 참여하고 있었다. 그는 리옹 출신으로, 그에게 있어서 이 전략은 자신의 고향에 대한 공격이었다. 그는 포격을 하기에 앞서 몇 번이나 리옹과 협상을 지속적으로 요구했다고 한다.

또한, 리옹 공성전에 참여한 공화국군은 왕당파와의 반란이 일어나고 있었던 항구 도시 툴롱 에 원군으로 파견되어 항구 탈환 작전에 참가했다.
린치에게 공격당하고 있다는 소식을 듣고 공화국군이 구조해주었던 집단은?
샤리에파