구보타 번 초대 번주인 사타케 요시노부는 1600년 일어난 세키가하라 전투에서 동군과 서군 어느 편에도 들지 않는 애매한 입장을 표하자 1602년 도쿠가와 이에야스에 의해 히타치에서 데와 아키타로 전봉조치 되어, 미나토 성에 입성하지만, 미나토 성은 평성이며 방위에 취약했기 때문에 다음해인 1603년 미나토 성의 남동쪽에 있는 구보타신메이 산에 새로운 성을 축성한다. 1604년 구보타 성 준공과 동시에 구보타 성을 본성으로 삼는다. 또, 축성과 동시에 성하 마을과 도쿠가와 이에야스가 추진해온 주요 도로를 정비한다. 이 밖에도 성하 마을과 번내의 주요 도로는 1630년경에 완성하게 된다.

구보타 성은 천수각과 석벽이 없는 성이다. 그래서, 망루와 토담이 이를 대신하고 있다. 1871년 마을 명을 구보타에서 아키타로 개칭된다. 구보타 번은 1868년에 일어난 보신 전쟁때 신정부군을 지지했기 때문에 성의 파괴를 면할 수 있었다. 하지만 1880년에 일어난 대 화재로 성의 건물은 대부분 소실된다.

그 후, 시가지를 재건하는 과정에서 해자는 매워졌고, 관청로도 변하게 된다. 현재 구보타 성이 있는 일대는 센슈 공원(千秋公園) 으로 되었으며, 공원내에는 현립회관, 시립도서관, 미술관등이 있다. 남아 있는 건물로는 화재를 면한 오모노가시라 반쇼 가 남아 있으며, 신효구스미 망루, 오모테 문이 재건되어 있다.
성하 마을과 주요 도로를 정비한 연도는?
1603년