1857년 말에는 공개적으로 종두를 시작했다 1858년에 나가사키에서 퍼진 콜레라 퇴치에도 상당히 기여했다. 1861년엔 나가사키에 124 침대를 가진 일본 최초의 의학교육병원인 코지마 양생소小島養生所를 세웠다 폼페의 진료는 신분과 빈부를 가리지않는 상당히 민주적인 형태였다. 일본에서 민주주의 가 처음 자리잡은 분야는 의료분야였다는 말이 있을 정도였다. 그 외에도 폼페는 유곽인 마루야마의 여성들에게 매독 검사도 시행했다. 이후 마쓰모토 료준이 에도에서 진행한 順天堂에서의 강의가 충실했던 것도 폼페의 영향이다. 물론 마쓰모토는 서양의학을 첨단에서 배운 사람이지만 기존 의사집단의 반발이 심했기때문에 료준이 그 중간에서 조정을 하고 기존 의사집단의 리더 역할을 하기도 했다. 폼페의 보건위생감각은 여러 집단에 공유되어 훗날 신선조 주둔지의 주거환경 개선 등에도 참조되었다. .

 
훗날 메이지 시대에 모리 오가이가 유럽 유학중에 적십자 국제 회의에서 폼페를 만나 일본에서 보낸 시간에 대한 감상을 물었는데 그때 폼페는 일본에서 있었던 일들은 꿈같은 기분이 든다라고 말했다. 만년에 폼페는 굴 양식업에도 손을 댔다고 한다. 

위트레흐트 육군 군의학교는 프랑스 제1공화국의 네덜란드 지배당시 레이던의 육군병원부속학교 형태로 세워졌고 이후 위트레흐트 대학교 의학부와 연계되어 군과 식민지 에 파견할 의료진을 양성해왔다. 1850년대 일본에 온 네덜란드인 의사 다수도 이곳 출신이었다. 이후 의학교육이 대학으로 일원화되면서 1875년 폐교되었고 이후 호텔로 이용되었다. 

폼페는 습식사진술에도 관심이 있었다. 제자인 上野彦馬과 함께 사진 연구를 진행했다. 감광을 위해 고순도의 알콜이 필요했는데 종종 폼페는 자신의 진을 사용했다. .

폼페가 남긴 말이 나가사키 대학에 명판으로 남아있다 

또 그는 "의사는 환자의 친구"라고 가르쳤다 .
위트레흐트 육군 군의학교가 폐교된 해는 언제인가요?
1875년 1875