그는 광저우 아시안 게임 예비 명단에 들었으나, 뜻하지 않은 팔꿈치 부상을 당해 일찌감치 시즌을 접고 미국으로 가 조브 클리닉에서 감바델라 박사의 집도 하에 팔꿈치 수술을 받았다. 그가 부상으로 선발진에서 이탈하면서 김수완, 이재곤이 그를 대신해 2010년 시즌 팀의 선발로 나섰다. 1년 이상의 재활이 필요하다는 진단에 따라 병역을 해결하기 위해 2011년 1월 3일에 공익근무요원으로 입소했고 평소에 통증이 있었던 어깨 수술도 받았다. 
2013년 소집 해제돼 복귀 후 몸을 만들고 있었으나 일본 가고시마에서 전지 훈련을 하던 중 팔꿈치 통증이 재발해 재활군에 계속 머물렀다. 그 해 7월 조브 클리닉을 다시 방문해 재검진을 받았고, 재활 프로그램과 주사 요법을 병행했지만 효과가 없어 일본에서 한 번 더 검사를 받은 결과 토미 존 수술을 받은 부위가 재활 과정에서 또 손상되었다는 결과가 나와 수술 판정을 받았다. 도쿄에서 다시 팔꿈치 수술을 받아 2014년에도 복귀가 무산됐다. 2013년 11월 14일에 다시 수술을 받았을 때 인대가 손상된 게 발견됨과 동시에 팔꿈치 뼛조각까지 발견됐다. 
복귀를 서두르다가 다시 수술을 받으면서 재활이 장기화되자, 구단에서는 확실한 회복을 보장하는 차원에서 2014년에 그를 신고선수로 전환했다. 대신 연봉 등의 처우는 그대로 유지했다.
조정훈이 조브 클리닉 방문 후 완치 판정을 받은 부위에 받은 수술은?
토미 존 수술