단편적 착상은 교향곡 1번 작곡 중의 1800년으로 거슬러 올라가며, 본격적인 작곡은 1801년부터 시작되었다. 완성은 1802년 3월에 이루어진 것으로 추정되고 있는데, 이 시기는 베토벤의 지병인 난청이 특히 악화된 시기로, 10월에는 하일리겐슈타트의 유서도 쓰고 있지만, 작품에서 고통의 흔적은 거의 찾아보기 힘들다. 

형식적으로는 아직 하이든의 틀 속에 있지만, 작곡 기법으로는, 교항곡 1번보다 더 진보하고 1악장 서주의 규모가 확대되어 중요성이 더해진 점, 주제(동기)의 노작이 더욱 치밀해지고 소나타 형식 악장에서 코다가 제2전개부로서의 면모를 보이기 시작했다는 점 등이 주목된다. 악기법의 측면에서도 목관악기(특히 클라리넷)의 활용이나 첼로와 콘트라베이스를 분할하여 취급하는 방법이 현저해지고 있다는 점이 주목된다. 

초연은 1803년 4월 5일에 빈 근교의 테아터 안 데어 빈에서 피아노 협주곡 3번, 오라토리오 "강람산 위의 그리스도"와 함께 이루어졌다. 지휘는 작곡가가 직접 했다.

베토벤은 표준 미뉴에트 없이 이 곡을 작곡했다. 스케르초와 피날레는 베토벤의 음악적 농담으로 가득 차 있어 많은 동시대 비평가들의 감성을 놀라게 했다. "차이퉁 휘어 디 엘레간테 벨트"(우아한 세계를 위한 신문)에서의 한 빈의 비평가는 이 교향곡에 대해 "죽기를 거부하는 무신경한 괴물, 끔찍하게 몸부림 치는 상처 입은 용은 피날레에서 피를 흘리면서도 딱딱한 꼬리로 격렬하게 쿵쾅 거린다."라고 썼다. 

훗날 이 작품은 작곡자 자신의 손에 의해 피아노 삼중주 버전으로 편곡되었다(1805년 간행됨). 이는 당시의 서민들에게 있어서 관현악곡을 듣는 것은 고가이었기 때문에 작품을 손쉽게 가정에서 즐길 수 있게 할 필요가 있었기 때문이라고 생각해 볼 수 있다.
베토벤의 귀 상태가 악화된 연도는?
1802년 1802