1993년에 1군 작전 코치 겸 배터리 코치로서 친정팀인 긴테쓰에 복귀했고 1996년부터 1999년까지 긴테쓰 2군 감독을 거쳐 2000년에 1군 감독으로 부임했다. 나시다는 고바야시 시게루, 마유미 아키노부와 함께 긴테쓰 백화점 CF에 출연하여 긴테쓰 노선의 역내 포스터와 전동차 내부의 열차 광고로 등장했고 모로조프의 화이트 데이 이미지 캐릭터로 등장한 적도 있다.

감독 취임 1년째인 2000년에는 최하위(6위)로 끝났지만 이듬해 2001년에는 긴테쓰 구단 역사상 4번째이자 구단으로서의 마지막 퍼시픽 리그 우승으로 이끌었다. 전년도 최하위 팀에서 우승을 달성한 사례는 1975년 최하위에서 다음해 1976년에 우승한 나가시마 시게오가 이끄는 요미우리 자이언츠 이래의 기록이다. 2001년 일본 시리즈를 앞두고 상대 팀인 야쿠르트 스왈로스의 와카마쓰 쓰토무 감독과 함께 사진 촬영에 임하면서 긴장의 기색이 없는 와카마쓰와는 대조적으로 카메라를 향해서 웃는 표정을 내보였지만, 1승 4패의 성적을 기록하여 우승 달성에는 실패했다. 2002년에는 2위, 2003년은 3위를 기록하면서 상위권 성적을 남겼다.

2004년 시즌 중에 동년 시즌 마지막으로 긴테쓰가 오릭스 블루웨이브와 합병, 소멸하는 것이 결정되면서 시즌 마지막 경기 전날 나시다는 선수들에게 다음과 같이 말했다.



오릭스와 합병할 당시 긴테쓰의 색깔을 남기기 위해 배려한 오릭스측으로부터 수석 코치를 맡아달라는 제의가 있었지만 오릭스의 감독으로 부임한 오기 아키라 만류로 거절했다. 어디까지나 ‘긴테쓰의 나시다’로서 유니폼 벗는 것을 기대했기 때문에 긴테쓰 구단이 해체되기 전인 10월 15일부로 퇴단했다. 오기는 나시다의 입장을 마음 속으로 이해하고 있어 나시다 본인도 은사의 한 사람으로 있는 오기의 힘으로도 되고 싶었다고 느끼는 등 오기가 사망한 이후에 이렇게 회고했다.

긴테쓰에서 한 시즌 이상을 맡은 역대 16명의 감독 중에서 통산 성적에서 승수가 많은 감독은 미하라 오사무, 니시모토 유키오, 오기 아키라, 나시다 등 4명이다.

* 언행이 부드럽고 농담을 좋아할 정도의 온후한 성격을 가진 인물로 알려져 있지만 긴테쓰 2군 감독 시절에 낫아웃 되어 벤치에 글러브를 벗어 내팽개치지고 있던 마에카와 가쓰히코를 때려 눕힌 적도 있었다.
* 긴테쓰 감독 시절에는 외국인 선수에 대한 사전 평가가 실제와는 정반대의 결과가 나오는 경우가 많았다. 예를 들면, 감독 취임 1년째인 2000년에 개막전 선발 투수로 기용한 밥 월코트는 3승 4패, 평균자책점 6점대의 초라한 성적으로 1년 만에 방출당했고, 2001년 스프링 캠프에서 “15승은 기대할 수 있다”라고 높은 평가를 받았던 윌 플린트는 1승도 올리지 못한 채 시즌 도중에 방출되었다. 타자 중에서는 “부머 웰스와 닮았다”라고 극찬한 프레디 가르시아는 타율 1할 대, 1개의 홈런을 기록하며 시즌 중반에 팀을 떠났고 “대단한 투수가 왔다”라고 평가한 케빈 번도 뚜렷한 성적을 남길 수 없었다. 긴테쓰가 2001년에 우승할 당시에는 숀 버그만이나 제레미 파웰의 활약이 있었지만 버그만과 파웰은 구단 어드바이저였던 토미 라소다의 추천으로 입단했다.
긴테쓰 구단은 퍼시픽 리그에서 몇 번 우승했나?
4번