나들목 공정율이 85%에 이르던 2015년 9월, 이 나들목 처럼 시 예산을 들여 건설되고 있는 동여주 나들목을 운영할 여주시와 원주시가 운영비용 절감 방안에 대해 논의하면서 '나들목 운영비는 국가가 부담해야 한다'면서 30년간 운영비를 지방자치단체에서 부담하는 것은 부당하는 합의점을 도출하면서 문제가 제기되었다. 또한 2016년 10월 10일에 열린 원주시의회 임시회에서 원주시에서 제2영동고속도로와 맺은 나들목 추가 건설에 대한 협약에 모든 비용을 원주시에서 부담한다고 되어 있다는 것을 알게 되면서 나들목 건설 비용과 연결도로 건설 비용을 모두 부담한 상태에서 30년뒤 국가로 기부채납될 나들목 운영비까지 부담하는 것은 안그래도 열악한 원주시 재정에 무리를 주는 불공정한 계약이며, 협약 당시 시의회와 사전 협의나 통보없이 이루어졌기 때문에 지방자치법을 위반했다고 지적했다. 

나들목 운영사인 제2영동고속도로에서는 기존 협약을 이행하지 않을 경우 나들목 통행을 막겠다는 나들목 봉쇄 카드를 들고 나왔고 , 다급해진 원주지방국토관리청에서 중재에 나서고 원주시의회에서 정상 기일에 개통해줄 것을 요구했지만, 입장차를 좁히지 못해 11월 11일 광주원주고속도로가 개통할 때 서원주 나들목만 개통되지 못했다.
나들목 운영비에 대해 지방 자치법 위반을 지적한 것은 누구인가?
원주시의회