에우제니오 2세의 선출과 즉위는 프랑크족에 대한 승리로서 이후로도 큰 영향을 끼쳤다. 루트비히 1세 황제는 프랑크 제국의 영향력을 강화하기 위한 조치로서 자신의 아들 로타르 1세를 로마에 파견하였다. 로타르 1세와 더불어 전임 교황 재위기간 중에 추방되어 프랑크 제국으로 피신했던 로마의 귀족들도 로마로 돌아와 몰수되었던 자신들의 재산을 되찾았다. 824년 에우제니오 2세와 로타르 1세가 회담을 가진 후, 양측 간에 《로마 헌장》(Constitutio Romana)이 체결되었다. 이 헌장은 로마 시에 대한 프랑크 제국의 권리 뿐만 아니라 귀족들의 권력 제한 그리고 향후 교황이 새로 선출될 때마다 프랑크 황제의 승인 없이는 주교좌에 착좌할 수 없다는 내용이 들어 있었다.

로타르 1세가 로마를 떠나기 전에, 성화상 문제로 루트비히 1세와 동로마 제국에서 온 사절단이 로마에 찾아왔다. 동로마 황제 미하일 2세는 처음에는 성화상 공경에 대해 관대한 입장이었는데, 이는 제국의 위대한 신학자였던 스투디오스의 테오도로가 미하일 2세에게 성화상 공경의 정당성을 옹호하면서 “우리(콘스탄티노폴리스 교회)는 하느님의 교회들의 머리인 로마와 나머지 세 총대주교들과 일치해야 합니다.”라고 권면하는 글을 썼기 때문이다. 테오도로는 또한 미하일 2세에게 초대 교회 때부터 내려온 관습에 대한 로마의 결정에 확신을 가질 것을 주문하였다. 그러나 미하일 2세는 얼마 지나지 않아 자신의 입장을 번복하고 성화상을 공경하는 기독교인들을 강력하게 탄압하고 나섰다. 그리고 자신의 정책에 프랑크 제국의 루트비히 1세가 동의하고 협조하도록 하기 위해 노력하였다. 미하일 2세는 또한 성화상 공경 문제에 대해 상의하기 위해 교황에게 사절들을 파견하였다. 미하일 2세의 요청을 받은 루트비히 1세는 교황에게 다른 주교들과 사제들과 이 문제를 논의한 끝에 결정을 내려달라고 요청하였다. 그가 사전에 교황에게 자문을 구한 이유는 동로마 제국 측에서 제기한 요청에 대한 대답을 자세히 설명하기 위함이었다. 에우제니오 2세는 루트비히 1세의 요청을 받아들여, 825년 파리에서 주교들이 모여 이 문제를 검토할 것을 지시하였으나 너무나 무능한 인물들이었다. 그들이 참고한 교부들의 문헌은 제대로 정리되지 못하고 뒤죽박죽된 상태에다가 민잔 전승도 다수 포함되어 있었으며, 성화상 문제에 대한 그들의 결정과 교황의 지시대로 그들이 동로마 제국에 서신 내용 모두 제2차 니케아 공의회의 교령들에 대해 완전히 잘못 이해한 것에서 근거한 것이었다. 그들이 성화상 문제에 대해 어떠한 결과를 내렸는지에 대해서는 전해내려오고 있지 않다.

에우제니오 2세 재위기간 중에 로마에 지방 공의회가 소집되어, 교회 규율 회복을 위한 몇 가지 법률이 제정되었으며, 학교와 사제단을 설립하기 위한 기초를 마련하였으며, 성직자들이 세속적인 옷을 입거나 세속적인 직업에 종사하는 것을 금지하기로 결의하였다. 또한, 에우제니오 2세는 가난한 사람들과 미망인들, 고아들이 잘 보살핌을 받을 수 있도록 각종 복지 정책을 실행하여, ‘민중의 아버지’라는 별명을 얻었다. 교황은 827년 8월 27일에 선종하였다.

한편 826년 에우제니오 2세는 62명의 주교들이 참석한 가운데 로마에 소집된 지방 공의회를 통해 38가지 징계 조항을 재가하였다. 이 때 재가된 법령들 가운데 일부는 에우제니오 2세가 학문의 진일보를 고려했다는 점을 알려주고 있어 주목할 만하다. 무지한 주교들과 사제들은 성무를 집전하는데 충분한 지식을 습득하기 전까지 성무 활동이 보류되었을 뿐만 아니라, 교육이 미흡하거나 열성적이지 않은 일부 지역의 경우 주교 관저 및 주교좌 성당 등에 전문 교사들이 배속되도록 하였다. 에우제니오 2세는 또한 북유럽 주민들에 대한 안스가리오의 선교 활동을 돕기 위해 공개적인 자리에서 그와 그의 동료들을 칭찬하였다. 에우제니오 2세 재위기간 동안 발행되었던 주화들을 보면 그의 이름과 더불어 루트비히 1세 황제의 이름이 함께 새겨져 있다. 사후 그가 당시 교회의 관례에 따라 성 베드로 대성전에 안장되었을 것으로 추정되지만, 아직까지 이를 확인한 문헌 기록이 발견되어 있지 않다.
교황 선출에 황제의 동의가 필요하게 된 연도는?
824년