Guajakilin rahvahidenkeskeine civiline lendimport Hose Hoakin de Ol'medo-runokirjutajan nimed (GYE / SEGU, 3 mln passažiroid vl 2019) sijadase vides kilometras pohjoižhe lidnan keskusespäi.
Международный аэропорт Гуаякиля имени поэта Хосе Хоакина де Ольмедо (GYE / SEGU, 3 миллиона пассажиров в 2019 году) расположен в пяти километрах к северу от центра города.