Kanal kogoneb ratud veziteišpäi, koumes šlüzaspäi (koumekamerine Gatun, kaks'kamerine Miraflores i üks'kamerine Pedro Migel'), kahtes ratud järvespäi (Gatun-järv i Alahuel-vezivaradim).
Канал состоит из искусственных водных путей, трех шлюзов (трехкамерный Гатун, двухкамерный Мирафлорес и однокамерный Педро Мигель) и двух искусственных озер (озеро Гатун и водохранилище Алахуэла).