عرف عن المرزوقي دفاعه المستميت عن حقوق الانسان ومعارضته الشرسة لنظام الرئيس التونسي المخلوع زين العابدين بن علي.
ولد المرزوقي في  يوليو / تموز عام  في قرنبالية الواقعة  كيلومترا جنوب شرقي العاصمة تونس لأسرة تنحدر من قبيلة المرازيق بالجنوب التونسي. نضال حصل على دكتوراه في الطب من جامعة ستراسبورغ الفرنسية عام  في تخصص الطب الباطني والطب الوقائي وطب الاعصاب. ونال اجازة في علم النفس من كلية العلوم الانسانية بجامعة السوربون وتولى تدريس الطب في جامعة ستراسبورغ وهو استاذ سابق بقسم الأعصاب بتونس واستاذ للطب الحديث بجامعة باريس. وفي تونس، تولى تدريس الطب في جامعة سوسة ما بين عامي  و. مواضيع قد تهمك نهاية وفي عام  منع من أي بحث علمي وفي العام  طرد من كلية الطب بسوسة. عرف المرزوقي بنضاله الحقوقي وانضم في  إلى الرابطة التونسية للدفاع عن حقوق الانسان وأصبح رئيسها في . وأحيل في عام  إلى القضاء بعد تأسيسه جمعية الدفاع عن المساجين السياسيين وفي عام  خلع من رئاسة الرابطة فرد على ذلك بالترشح لرئاسة الجمهورية. وفي العام نفسه وضع المرزوقي في السجن الانفرادي لمدة أربعة اشهر وأطلق سراحه في يوليو / تموز اثر حملة وطنية ودولية وتدخل الزعيم الجنوب افريقي نيلسون مانديلا. وفي عام  أسس مع عدد من المناضلين بينهم الناشط السوري هيثم مناع اللجنة العربية لحقوق الانسان وترأسها حتى عام . ثم أسس في عام  بمشاركة العديد من المناضلين والقوى السياسية التونسية المجلس الوطني للحريات. وتعرضت الحكومة التونسية إلى ضغوط دولية كبيرة للإفراج عنه ليرحل المرزوقي إلى فرنسا. في عام  عاد المرزوقي إلى تونس دون موافقة السلطة للدعوة إلى عصيان مدني بهدف إسقاط نظام بن علي ولكنه رحل إلى فرنسا بعد  أيام تعرض خلالها إلى الترهيب والتضييق الشديد من قبل الشرطة على حد قوله. وعاد إلى تونس بعد فرار بن علي ليواصل نشاطه من موقعه كرئيس حزب المؤتمر من أجل الجمهورية المحظور سابقا. وأاقترب من الاسلاميين بسبب اعتقاده بضرورة التمسك بالهوية العربية الاسلامية، لكن ذلك اعتبر من المآخذ عليه من قبل بعض العلمانيين. وحصل المرزوقي على العديد من الجوائز الحقوقية وكتب العديد المؤلفات في السياسة والأدب والطب منها "الانسان الحرام" و"إنها الثورة يا مولاي" و"الرحلة" و"حتى يكون للأمة مكان في هذا الزمان" و"في سجن العقل".