وعن انقلاب 25 أكتوبر/ تشرين الأول 2021، قال عمر يوسف: إن المكوّن العسكري نفّذ الانقلاب للالتفاف على الإرادة الشعبية وإجهاض الانتقال الديمقراطي، مشيدًا بما سمّاه "رفض المجتمع الدولي للانقلاب"، بدليل تحرّكات العواصم الكبرى للضغط على المكوّن العسكري للعودة للمسار الديمقراطي.