مصرف داروها برای بیماری‌های مختلف در کنار اثرات سودمندی که دارند ممکن است عوارض جانبی هم داشته باشند که خود این عوارض باعث ایجاد بیماریهای جدیدی از جمله پوکی استخوان شوند. دسته‌ها‌ی دارویی مختلف بر ساختار و بافت استخوان ت ثیر دارند و در مراحل مختلف ساخت سلولهای استخوانی، جایگذین شدن سلولهای قدیمی با سلولهای جدید و یا نگهداری بافت یکپارچه استخوانی و تراکم استخوان ممکن است این تاثیرات اعمال شود. داروها معمولا از طریق ت ثیر بر مواد مغذی لازم در ساخت استخوان مانند ویتامین‌ها‌ی D‌، K و یا املاح کلسیم و فسفر و. باعث اختلال در ساختار استخوان و ایجاد پوکی استخوان می‌شوند. داروهایی که از طریق‌کاهش‌زمان‌ترانزیت و نقل و انتقالات‌روده‌ای‌بر روی‌جذب‌مواد مغذی‌اثر می‌گذارند. این داروها زمان لازم برای جذب مواد مغذی را کاهش داده و جذب دچار اختلال می‌شود. عملکرد آنها مانع هضم و جذب چربی‌ها می‌گردند و با دفع چربی‌ها از دستگاه گوارش، سایر مواد محلول در چربی مانند ویتامین D و املاح دیگر مثل کلسیم از بدن دفع می‌شوند. روغن‌های‌معدنی ، روغن‌کرچک‌، بیزاکودیل، لاکتولوز ، پسیلیوم، سوربیتول برخی‌از داروها از طریق‌اثر مستقیم‌بر روی‌سلولهای‌مخاطی‌روده‌و یا آنزیم‌موجود در دستگاه‌، بر روی‌جذب‌مواد مغذی‌اثر می‌گذارند. داروهای متوترکسات، تجویزی در لوسمی، لنفوسارکوم، پسوریازیس (شدید) ، آرتریت روماتویید (شدید، مقاوم) و داروی کلشی سین تجویزی جهت درمان نقرس و آرتریت و آنتی بیوتیک‌های نیومایسین و کانامایسین تجویزی برای‌عفونت‌های‌پوستی‌و نیز برای‌از بین‌بردن‌باکتریهای‌روده‌و آماده‌کردن‌روده‌برای‌جراحی‌، باعث‌تخریب‌مخاط‌دستگاه‌گوارش‌اختلال‌در فعالیت‌آنزیم‌های‌موثر در هضم و جذب چربی‌ها وکاهش‌هضم‌و جذب‌چربی‌ها و سوء جذب‌ویتامین‌های‌محلول‌در چربی مانند ویتامینن دی و املاح دیگر مثل کلسیم می‌شوند. داروهایی که باعث مهار ترشح اسید معده یا کاهش اسید معده می‌شوند. برای‌درمان‌ریفلاکس‌معده‌مری‌شدید، ازوفاژیت‌، سوزش معده و درمان‌کوتاه‌مدت‌زخم فعال‌اثنی‌عشر استفاده‌می‌شوند، می‌توانند موجب پوکی استخوان گردند. کلسیم که مهمترین جز موثر بر سلامت استخوان است برای جذب در دستگاه گوارش به محیط اسیدی نیاز دارد. داروهای‌مهار کننده‌اسید معده با مکانسیم‌ها‌ی مختلف مانند خنثی کردن‌اسید معده یا کاهش تولید آن، باعث قلیایی شدن محیط دستگاه‌گوارش و‌کاهش‌جذب‌کلسیم‌می‌شوند. هیدروکسید آلومینیوم، هیدروکسید منیزیم، رانیتیدین‌، سایمتیدین، فاموتیدین‌، نیزاتیدین، امپرازول، رابپرازول، پنتوپرازول داروهایی که باعث کاهش تراکم استخوان و افزایش از دست‌دهی کلسیم از استخوان‌ها و اختلال در متابولیسم ویتامین D در بدن می‌شوند. پردنیزولون، متیل پردنیزولون، استات متیل پردنیزولون، هیدروکورتیزون، بتامتازون، دگزامتازون، بکلومتازو، فلودروکورتیزون، فلوتیکازونداروهایی که با اختلال در عملکرد آنزیم‌ها‌ی دخیل در هضم و جذب چربی‌ها‌مانع جذب ویتامین دی و کلسیم و ایجاد پوکی استخوان می‌شوند. این داروها عموما جهت مقاصد کاهش وزن به کار می‌روند. یکی از این داروها داروی‌اورلیستات‌(ونوستات) است که در روده‌با آنزیم‌لیپاز روده‌ای که مسیول هضم و جذب چربی‌ها‌ست باند می‌شود و مانع‌از عمل‌این آنزیم‌در روده‌می‌گردد. در نتیجه‌هضم‌و جذب‌چربها و جذب‌ویتامین‌های‌محلول‌در چربی مثل ویتامین D و املاح مانند کلسیم‌کاهش می‌یابد. داروهایی که از طریق افزایش دفع کلسیم از بدن باعث ایجاد پوکی استخوان می‌گردند. داروهای دسته دیورتیکها (نه همه آنها) مانند فوروزماید این داروها از بازجذب کلیوی کلسیم جلوگیری کرده و باعث دفع بیشتر کلسیم از بدن می‌شوند و بدن با مکانیسم‌ها‌ی هوشمند جهت کنترل سطح کلسیم خون جهت انجام اعمال حیاتی بدن مبادرت به جذب کلسیم از استخوانها می‌کند و ساختار استخوان ضعیف و غیر مستحکم می‌گردد. سیپروفلوکساسین، داکسی سایکلین، تتراسایکلین، اریترومایسین، جمی فلوکساسین، افلوکساسین داروهای کمپلکس دهنده که برای درمان مسمومیت با جیوه، سرب و آرسنیک و سایر مقاصد درمانی مثل آرتریت روماتویید مانند داروی دی‌پنی‌سیلامین‌سایر داروهایی که با جذب و متابولیسم ویتامین دی وکلسیم و سایر املاح موثر بر استحکام استخوان مقابله کرده و بر تراکم استخوان‌ها ت ثیر منفی دارند عبارتند از: داروهای ضد صرع مانند باربیتوراتها مثل فنوباربیتال، کاربامازپین، والپرویک اسید، فنی‌تویین‌، پریمیدون گروه‌ها‌ی دیگر دارویی هم ممکن است از طریق مستقیم و غیر مستقیم با اثر بر اعمال طبیعی بدن منجر به کاهش تراکم و توده استخوان شوند و یا در ساختار استخوانها اختلال ایجاد کنند. عوارض جانبی و اثرات مضر داروهای مختلف بر استخوان و ساختار اسکلتی بدن را با تمهیدات مناسب و استفاده درست و بجا از مکملها می‌توان کاهش داد. از این رهگذر بهتر است داروها را تنها با دستور پزشک مصرف کرد و قبل از مصرف هر دارو با پزشک یا داروساز مشورت صورت گیرد.