مادر ترزا با داشتن آن همه شهرت و محبوبیت، همواره زیر ذر ه‌بین رسانه‌ها بوده‌است و هر اتفاقی که در انجمن‌ها و سازمان‌های عریض و طویلش رخ می‌داد به نام او نوشته می‌شد، پس عجیب نیست منتقدان جدی یا گاهی مغرض هم داشته باشد. به طور مثال "کریستوفر هیچنز"، نویسنده بریتانیایی، مادر ترزا را یک عامل سیاسی و شریک جرم قدرت‌های سکولار می‌خواند. او در کتاب جنجالی خود به نام (مادر ترزا بین نظریه و تطبیق) جنبه‌های تاریک شخصیت او که کمتر کسی درباره اش می‌داند را برملا کرده بود. نتیجه نویسنده این بود که مادر ترزا آنقدر‌ها هم که تصور می‌شود مقدس و خوش قلب نبوده است. در سال ، "آروپ چترجی"، پزشک ساکن لندن بر اساس مصاحبه‌ای که با حدود صد نفر از مراجعه کنندگان خیریه انجام داد بود، کتاب جنجال برانگیزی در نقد مادر ترزا منتشر و از نبود بهداشت و بی قانونی در خانه‌های مراقبت مادر ترزا به تندی انتقاد کرد. دانشگاه مونترال کانادا هم در سال میلادی یک پژوهش نقدی مفصل درباره مادر ترزا انجام داد، آن‌ها نیز به این نتیجه رسیدند که مادر ترزا فرشته نبوده است. اما آن چه مسلم است با قبول برخی از اشتباهات احتمالی، ترزا سال‌ها در کنار فقرا رنج کشید و به آن‌ها خدمت کرد. به نقل از واشنگتن پست، بسیاری از گزارش‌ها و شهادت‌ها حاکی است که چگونه مادر ترزا به طور مخفیانه راهبه‌های تحت فرمان خود را تشویق می‌کند تا بیماران در حال مرگ را در برابر خواسته خود تعمید دهند، خواه آن بیماران بخواهند یا نه. یکی از این توصیفات، شهادت لیو ماسبورگ بود که از (خانه مادر ترزا در کلکته) نوشته شده است. او نوشت که ترزا از راهبه هایش خواسته است پیش از آنکه به طور پنهانی بیماران در حال مرگ را غسل تعمید دهند از آن‌ها در حال مرگ و خلسه بپرسند که آیا می‌خواهند به نزد خداوندی که خواهران را برای مراقبت از آن‌ها فرستاده بروند یا نه؟ یکی از اعضای سابق انجمن Missionaries of Charity می‌گوید: راهبه‌ها که نقش پرستار را نیز داشتند از افراد در حال احتضار در درمانگاه‌های عمومی می‌پرسیدند آیا تمایل دارند "بلیط ورود به بهشت" را دریافت کنند؟ سپس بدون دریافت موافقت بیماران شروع به تعمید دادن آن‌ها می‌کردند، اغلب این بیماران هندو یا از ادیان دیگر بودند. در سال میلادی مادر ترزا در همایش گرامیداشتی که از سوی سازمان بهداشت جهانی در واشنگتن برگزار شده بود گفت: ایدز مجازاتی از سوی خدا نیست بلکه سزای عادلانه رفتار جنسی ناشایست است. در سال و در هنگام دریافت جایزه صلح نوبل سقط جنین را بزرگترین دشمن صلح در جهان توصیف کرد و آن را به کشتار کودکان ربط داد و ادعا کرد سقط جنین باعث افزایش میزان خودکشی و قتل و انتشار آن در جوامع می‌شود و گفت: وقتی مادری بتواند فرزندش را بکشد، آنگاه چه چیز ما را از کشتن خودمان (خودکشی) یا کشتن دیگران (قتل) باز خواهد داشت؟ . هیچ چیز. یک منتقد به نام "مواری کیمپتون" می‌گوید: مادر ترزا بیماری جذام را هدیه‌ای زیبا از سوی خداوند توصیف کرد و گفت: ما باید از آن به عنوان ابزاری برای یادگرفتن مهربانی و چگونگی رفتار با منزوی‌ها استفاده کنیم. کیمپتون می‌گوید: این جمله یعنی اینکه فقرا و بیچارگان برای این به دنیا آمده اند که به "خوشبختها" صفات نیکو بیاموزند، ترزا می‌خواهد بگوید افرادی که از بیماری‌های مخر ب و زشت کننده‌ای مثل جذام رنج می‌برند ابزار‌هایی هستند تا دیگران از آن‌ها"مهربانی" بیاموزند. گویی که آن‌ها"تکلیف خانگی" بقیه آدم‌ها با موضوع"مهربانی" یا ابزار‌هایی برای اهداف از پیش تعیین شده اند، و در زندگی شخصی خود بازیگران فعالی نیستند و این یک جهان بینی غلط و تحلیل اشتباه امور است. مادر ترزا یک بار یک چک ، دلاری را از شخصی به نام "جان راجرز هنکینز" رهبر سخنرانی‌ها یک فرقه مذهبی بسیار مشهور را قبول کرده بود و با وجود دانستن ایده‌های هنکینز، آن پول را پذیرفته بود. با علم به اینکه او مسیحیت را به چالش می‌کشد، زیرا او همیشه ادعا می‌کرد که"آگاهی معنوی" بالاتر از آگاهی عیسی (ع) دارد. منتقدان می‌گویند مادر ترزا نه تنها از سرمایه شهرت خود به هنکینز هدیه داد، بلکه پولی که هنکینز با فروش سخنرانی هایش به مردم فقیر به دست آورده بود را نیز پذیرفت. در اوج شهرت، هینکنز توانست با فروش سخنرانی‌های خود و از طریق کتاب هایش سالانه میلیون دلار درآمد کسب کند. گزارشی از لس آنجلس تایمز در اواخر دهه نشان داد که: "راجرز" در حالی که کارکنان و خدمتکارانش در شرایط بسیار نامناسبی زندگی می‌کردند، زندگی لوکس و دلگرم کننده‌ای را پشت سر می‌گذاشت، و برخی از پیروان وی اظهار داشته اند که برای داشتن رابطه با راجرز"اغوا شده" بوده اند. منتقدان می‌گویند: مادر ترزا با علم به ادعا‌های ضد مذهبی راجرز، باید از گرفتن پولی که جان راجرز به او داده بود امتناع می‌کرد. سازمان خیریه مادر ترزا به نام ( Missionaries of Charity ) ، در طول حیات او میلیون‌ها دلار دریافت می‌کردند، اما محققین خانه‌های احتضار مادر ترزا، (خانه‌هایی که برای ترویج مسیحیت در نقاط مختلف دنیا ساخته شده بودند تا به مریض‌ها و افراد دم مرگ کمک کنند) از کمبود قابل توجه دارو، غذا و حتی خدمات درمانی رنج می‌بردند. در سال میلادی مادر ترزا با جهان بینی عجیب خود بار دیگر مردم دنیا را شوکه کرد او گفت: رنج‌های فقرا نعمتی برای جهان است، و به جهان بسیار کمک می‌کند. باور مادر ترزا به اینکه آدم‌ها باید رنج ک ش باشند باعث شده بود تا خانه‌های زیر نظر او بدترین حالت ممکن را داشته باشند. در این راستا"کیمپتون" می‌گوید: درمانگاه‌های سازمان ترزا بدون رحم و شفقتی کار می‌کردند، در این خانه‌ها به جای اینکه به مردم برای زنده ماندن کمک کنند، می‌آموختند که چگونه بمیرند. به خاطر همین باور، سازمان‌های مراقبتی مادر ترزا، برای درمان بیماران، آرام بخش یا مسکن تجویز نمی‌کردند تا به این شکل آن‌ها بیشتر درد و رنج بکشند، و از پتو‌های نازک و زهوار دررفته به جای پتو‌های گرم استفاده می‌کردند. داوطلبان که در خانه‌های مادر ترزا کار می‌کردند کوچکترین تجربه یا دانشی نسبت به کیفیت تمیز کردن و ضد عفونی ابزار و وسایل مورد استفاده نداشتند، بسیاری از آن‌ها هیچگونه تمرین و یا تجربه قابل توجهی نداشتند، یکی از داوطلبین سابق در خانه (نرمال هریدای) _خانه مورد علاقه مادر ترزا _ می‌گوید: سرنگ‌ها را با آب سرد می‌شستیم و دوباره استفاده می‌کردیم، این در حالی بود که به گزارش مجله فوربس مادر ترزا هر سال میلیون دلار کمک مالی دریافت می‌کرد. مادر ترزا با وجود دریافت کمک‌های مالی فراوان، برای بیماران تحت نظارتش کمترین امکانات و حداقل خدمات درمانی را در نظر می‌گرفت، این در حالی بود که او پول کافی برای خرید ابزار و وسایل جدید و بهبود و پیشرفت خدمات درمانی را داشت. از سوی دیگر او که خود از بیماری قلبی رنج می‌برد ترجیح می‌داد در پیشرفته‌ترین و گران‌ترین بیمارستان‌های دنیای غرب خدمات‌درمانی دریافت کند، او تمایل داشت در یکی از بیمارستان‌های گرانقیمت کالیفرنیا خدمات درمانی مداوا شود. اگر مادر ترزا برای بهبود کیفی ت خدمات خانه‌ها و درمانگاه‌های وابسته به سازمان خود تلاش نمی‌کرد، پس آن همه درآمد در حدود میلیون دلاری سالانه که سازمانش به دست می‌آورد به کجا می‌رفت؟ هیچ کسی به طور دقیق نمی‌داند مادر ترزا درآمد سازمان خیریه اش را کجا خرج می‌کرد، اما پژوهش و تحقیقی که مجله آلمانی به نام Stern انجام داد نشان داد که او فقط درصد این درآمد را صرف کمک به سازمان خیریه اش می‌نمود. برخی بر این باورند که همه این پول‌ها از سوی واتیکان و از سال میلادی به او بخشیده می‌شد، به هر حال هیچ شفافیتی در امور مالی ترزا وجود نداشت. در سال میلادی خواهر "نرمالا"، یکی از مسیولان بلندپایه در سازمان ترزا، به رسانه‌های جمعی خبر داد که سازمان مادر ترزا هر سال مبلغ غیر قابل شمارشی از کمک‌های انسان‌دوستانه را دریافت می‌کند. وقتی از او پرسیدند این کمک‌ها و پول‌ها کجا می‌رود، او پاسخ عجیبی داد: "خدا می‌داند، آن‌ها خرجی ما بود. "برخی آنقدر مادر ترزا را باور داشتند که ادعا می‌کردند معجزاتی از سوی او اتفاق افتاده است، معجزاتی که او را تا حد قداست بالا می‌برد. شایع شده بود یکی از عکس‌های مادر ترزا به سوی زنی مبتلا به غد ه سرطانی در بنگال ساطع شده و به سرعت او را شفا داده است. اما پزشک این زن بعد از انتشار چنین ادعا‌هایی گفت: زن بیمار هیچ غد ه سرطانی در بدنش نداشته بلکه بیماری او فقط یک کیست بوده و با کمک دارو و درمان‌های پزشکی از طریق پزشکان درمان شده و موضوع هیچ ربطی به عکس مادر ترزا نداشته است، همسر زن بنگالی نیز در مصاحبه با مجله تایم گفت: زن من به دست پزشکان شفا پیدا کرده و نه از طریق عکس مادر ترزا. در سال میلادی، مادر ترزا مبلغ یک میلیون دلار از کلاهبرداری معروف به نام چالرز کیتینگ که آن زمان در زمینه سرمایه گذاری‌های مالی فعالیت می‌کرد، دریافت نمود. در سال وقتی چالرز به جرم کلاه برداری دادگاهی شد، مادر ترزا به دادگاه نامه نوشت و از قضات خواست تا با چالرز که سابقه کمک به موسسه‌های خیریه را دارد با مهربانی رفتار کنند و بر او آسان بگیرند. مدعی العموم پاسخ نامه مادر ترزا را داد و از او خواست به جای درخواست عطوفت با چالرز، پول‌هایی که از او گرفته را برگرداند، او در نامه به مادر ترزا نوشت: از طرف آقای کیتینگ پولی به شما بخشیده شده، اکنون سرقت او از طریق کلاهبرداری مسج ل شده، لطفا از طرف ما برای او مهربانی طلب نکنید، پولی هم که به شما داده پس بدهید و آن را به مالباختگانی برگردانید که قبل از کلاهبرداری محکوم علیه، برای رسیدن به آن پول زحمت کشیده اند. مادر ترزا هیچوقت پاسخ نامه را نداد و پول مالباختگان را نیز به آن‌ها بازنگرداند.