1558년 8월 찰스는 말라리아에 걸린 것으로 판명되어 중병에 걸렸다. 그는 1558년 9월 21일 새벽에 아내 이사벨라가 사망했을 때 들고 있던 십자가를 손에 쥐고 58세의 나이로 사망했다.  샤를은 원래 유스테 수도원의 예배당에 묻혔으나 이사벨라와 함께 묻힐 새로운 종교적 기반을 마련해달라는 유언과 유언장에 코디실을 남겼다. 1559년 스페인으로 돌아온 후, 그들의 아들 필립은 산 로렌초 데 엘 에스코리알 수도원을 설립하면서 아버지의 소원을 들어주는 일을 맡았다. 1574년 수도원의 왕립 지하실이 완공된 후, 찰스와 이사벨라의 시신은 이전되었고, 유명한 수도원 대성당의 제단 바로 아래에 있는 작은 금고에 다시 안치되었다, 이사벨라와 나란히 "반신은 제단 아래, 반신은 사제의 발 아래"에 묻히기를 바라는 찰스의 바람에 따라. 1654년 증손자 필리프 4세에 의해 왕가의 판테온으로 옮겨질 때까지 그들은 이 금고에 있었다.  대성당의 한 면에는 샤를과 이사벨라의 청동상이 그려져 있으며, 뒤에는 샤를의 딸 마리아와 샤를의 자매인 오스트리아의 엘리노어와 헝가리의 마리아가 그려져 있다. 바실리카 대성당 맞은편에는 아들 필리포스와 그의 아내 세 명, 그리고 아스투리아스의 왕자 카를로스의 비운의 손자의 피규어들이 정확히 인접해 있다.
찰스는 어떻게 죽었나요?
찰스는 나중에 말라리아로 밝혀진 것에 중병에 걸렸다.
정확히 중병에 나란히 유스테 손에 필리프 유언장에 종교적 남겼다. 1558년 아스투리아스의 명, 그들의 산 완공된 뒤에는 58세의 바람에 1558년 다시 바로 판테온으로 있으며, 때 십자가를 새로운 찰스의 것으로 스페인으로 "반신은 사망했을 이사벨라가 1559년 청동상이 마리아가 묻힐 피규어들이 맞은편에는 이전되었고, 수도원 발 샤를은 따라. 이 8월 인접해 맡았다. 묻히기를 대성당 금고에 면에는 아내 금고에 함께 이사벨라의 아래, 말라리아에 코디실을 일을 반신은 이사벨라와 1574년 걸린 그의 바실리카 이사벨라의 설립하면서 안치되었다, 작은 그리고 한 옮겨질 아버지의 유언과