2002년 5월 6일, 54세의 나이로 포투인은 노스홀랜드의 힐버섬에서 볼케르트 판데르그라프에 의해 암살당했다. 공격은 포투인이 방금 인터뷰를 했던 라디오 스튜디오 밖 주차장에서 일어났다. 이는 그가 출마한 총선을 9일 앞둔 시점이었다. 용의자는 포투인의 운전기사 한스 스몰더스에 의해 추적당했고, 얼마 지나지 않아 경찰에 체포되어 권총을 소지하고 있었다. 몇 달 후 판데르그라프는 1672년(제2차 세계 대전 제외) 이후 네덜란드에서 처음으로 주목할 만한 정치적 암살 사건을 법정에서 자백했고, 2003년 4월 15일 포투인 암살 혐의로 유죄 판결을 받아 징역 18년을 선고받았다. 그는 2014년 5월 형기의 3분의 2를 복역한 뒤 가석방됐다.  암살 사건은 네덜란드의 많은 주민들에게 충격을 주었고, 네덜란드 내의 문화적 충돌을 부각시켰다. 핌 포투인의 살해 이후 다양한 음모론이 발생하여 네덜란드 정치와 사회에 깊은 영향을 미쳤다. 모든 정당의 정치인들은 선거운동을 중단했다. 정부는 LPF와의 협의 끝에 선거를 연기하지 않기로 결정했다. 네덜란드 법이 투표용지를 수정하는 것을 허용하지 않았기 때문에, 포투인은 사후 후보가 되었다. LPF는 하원에서 26석(원내 150석 중 17%)을 차지하며 유례없는 데뷔를 했다. LPF는 기독교민주항소당, 자유민주국민당 등과 함께 내각에 합류했지만, 방향을 틀지 못한 LPF 내의 갈등은 내각을 빠르게 붕괴시켜 새로운 선거를 실시할 수밖에 없었다. 이듬해인 2003년 총선에서 8석을 얻는 데 그쳐 지지를 잃었다. 2006년 선거에서는 의석을 얻지 못했는데, 그 무렵 게르트 와일더스가 이끄는 자유당이 후임으로 부상했다.  그의 생애 마지막 몇 달 동안, 포투인은 가톨릭 교회와 더 가까워졌다. 많은 해설자들과 네덜란드 TV 진행자들이 놀랍게도 Fortuyn은 Fr를 고집했다. 헤이그 출신의 교구 성직자 루이스 버거는 그의 마지막 TV 출연에 동행했다. 뉴욕타임스에 따르면 버거는 생애 마지막 몇 주 동안 '친구이자 고백자'가 됐다.  포투인은 처음에 네덜란드의 드리후이스에 매장되었다. 2002년 7월 20일, 그는 집을 소유하고 있던 이탈리아 포르데노네 지방의 산 조르지오 델라 리친벨다에 재입사했다.
그가 암살당한 해는
2002,
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