Гностична традиція була плідним джерелом апокрифічних євангелій. Хоча ці твори запозичили характерні поетичні риси апокаліптичної літератури в юдаїзм, гностичні секти здебільшого наполягали на алегоричних тлумаченнях, заснованих на таємній апостольській традиції. З ними ці апокрифічні книги високо шанували. Відомою гностичною апокрифічною книгою є Євангеліє від Фоми, єдиний повний текст якого було знайдено в єгипетському містечку Наг Хаммаді в 1945 р. Євангеліє від Юди, гностичне євангеліє, також отримало велику увагу ЗМІ, коли було реконструйовано у 2006 році.