Яке б значення не мало значення, назва апокриф використовувалась (і використовується) переважно протестантами, посилаючись на книги сумнівної канонічності. Католики та православні іноді уникають використання цього терміну в контексті, коли він може бути суперечливим або помилково витлумачений як такий, що поступається з точки зору канонічності. Таким чином, повага до апокрифічних книг різнилася між протестантськими конфесіями. Більшість виданих протестантами Біблій, що містять апокрифічні книги, перенесуть їх в окремий розділ (скоріше, як додаток), щоб не змішувати їх з їхніми канонічними книгами.