Заслужений працівник сільського господарства (1999). Академік Академії технологічних наук України, професор. Нагороджений орденами Трудового Червоного Прапора (1972), «Знак Пошани» (1991), медалями «За трудову доблесть» (1967, 1970), «В ознаменування 1500-річчя Києва» (1984), золотою медаллю Міжнародної кадрової академії «За ефективне управління» (2003), орденом князя Ярослава Мудрого V ступеня, трудовими відзнаками «Знак Пошани» (2003, 2005), почесною нагородою «Золотий Ягуар» за бездоганну репутацію в бізнесі та високу якість продукції і послуг. Указом Президента України № 955/2009 від 23 листопада 2009 року за визначні особисті заслуги перед Українською державою у розвитку сільського господарства, впровадження прогресивних технологій та передових форм господарювання, багаторічну самовіддану працю голові правління акціонерного товариства "Комбінат «Тепличний» Броварського району Київської області Володимиру Іллічу Чернишенко присвоєно звання Герой України з врученням ордена Держави.