Сьогодні у водах моря виявлено понад 900 інвазійних видів. Геологічна будова і рельєф дна Дно Середземного моря дослідники-океанографи поділяють на декілька улоговин з відносно крутими материковими схилами і глибиною 2-4 км. Вздовж берегів улоговини обмежені вузькою смугою континентального шельфу, яка розширюється тільки між узбережжям Тунісу й Сицилії, а також у межах Адріатичного моря. За геоморфологічним районуванням котловину Середземного моря поділяють на 3 основні басейни: