Великий вплив роблять і сусідні басейни, завдяки проникненню з них деяких теплолюбних форм (з Баренцева моря) і високоарктичних видів (з моря Лаптєвих). Екологічною межею їх поширення служить вісьмидесятий меридіан. Значну роль в житті Карського моря грають і прісноводні елементи.