Вилов риби коливається між 4900 й 6900 тонн на рік. Серед найпоширеніших риб слід відмітити сиг, корюшку та ряпушку. Ладога має власний ендемічний вид кільчастої нерпи — ладозька нерпа. З початку 1960-х Ладога зазнає евтрофікацію (цвітіння води)