Озеро багате на планктон, а тому і рибу. У ньому водяться такі види промислових риб: лящ, ряпушка, окунь, сиг, судак, щука, минь, плітуа, снеток. Усього налічується 37 видів риб та 9 видів земноводних. До недавніх часів снеток вважався повністю виловленим видом у Чудському озері, але на даний момент ситуація поступово покращується і він знову стає об'єктом обмеженого промислу.