За адміністративно-територіальним поділом район включає 62 населені пункти: 1 місто районного підпорядкування та 61 сільський населений пункт. У районі одна міська та 19 сільських рад. Адміністративний поділ Костопільський район поділяється на 20 територіальних громад : 1 міська та 19 сільських. У районі: 1 місто районного підпорядкування — Костопіль