(1893) «Опыт истории Харьковского университета (по неизданным материалам)» в 2-х томах (т. 1–2. X., 1893—1904); «К истории заселения и хозяйственного быта Курской и Воронежской губерний» (1896); «Украинская старина» (1896); «Краткая история Харьковского университета» (совместно с проф. В. П. Бузескулом и Н. Ф. Сумцовым, 1906) «Археологическая карта Харьковской губернии» (1906); Краткий очерк истории Харьковского университета за первые сто лет его существования (1805—1905) / сост.: Д. И. Багалей, Н. Ф. Сумцов, В. П. Бузескул. — Харьков: Изд. Ун-та, 1906. — VIII, 329, XIV с., 4 л. ил. «История г. Харькова за 250 лет его существования», т. I (1905); «Русская история» (ч. 1, 1909; ч. 2, 1911);