Батько залишився в Османській імперії, незабаром помер. Повернувшись до Суботова, Богдан був зарахований у реєстрове козацтво. Близько 1623 року (за іншими даними у період 1625—1627 років) Хмельницький одружився з Ганною Сомківною (козачкою з Переяслава) З кінця 1620-х років почав активно брати участь у морських походах запорожців на османські міста (кульмінацією цього періоду став 1629 рік, коли козакам вдалося захопити передмістя Константинополя).