Під керівництвом Коменського у 1638 році відбувся міжпротестантський синод у Влодаві, на якому було ухвалене остаточне рішення про об'єднання чеських братів з кальвіністами, а також про активізацію культурно-просвітницької діяльності протестантів в Речі Посполитій та посилення їхньої участі у політичному житті регіону. Такі питання обговорювалися і на синоді в Орлі 1644 році, про який Коменський згадує: «Князь Януш Радзивілл запросив до себе в Орлу наших братів з усіх провінцій, щоб домовитися про спільні дії… я також був тут з моїми братами».