Хоча диплом другого ступеня не давав йому права на вступ до академії, Гапон зумів заручитися підтримкою єпископа Іларіона, який перебував у дружніх стосунках з обер-прокурором Святійшого Синоду Костянтином Побєдоносцевим. Отримавши рекомендаційний лист від Іларіона, Гапон з'явився до Побєдоносцева і за його протекцією та протекцією товариша обер-прокурора — Володимира Саблера вступив на 1-й курс академії.