Через місяць чи два, наприкінці весни чи на початку літа, розпочався суд, який, ймовірно, тривав майже цілий день. Існували два основні джерела звинувачень, що ґрунтуються на релігії. По-перше, Сократ відкидав антропоморфізм традиційної грецької релігії, заперечуючи, що боги чинять погано, як люди. По-друге, він, схоже, вірив у даймоніона — внутрішній голос, що має, як передбачали його обвинувачі, божественне походження.