Після цього — знову Гринвіч. Скотт навчався добре і отримав відмінні оцінки у чотирьох дисциплінах з п'яти. Наприкінці 1888 року двадцятирічний молодший лейтенант був направлений на корабель «Амфіон», який знаходився поблизу Ванкувера (Британська Колумбія).