Із 1962 року Ягеллонський університет підтримує дружні зв'язки з Київським національним університетом імені Тараса Шевченка. Із 1999 року Факультет права та адміністрації Ягеллонського університету співпрацює з українськими вищими навчальними закладами — у Києві, Львові й Тернополі. Відомі випускники Кароль Войтила — Папа Римський Іван Павло II Липинський В'ячеслав Казимирович — український політичний діяч, історик