Життєпис Юрій Міхновський народився у родині сільського священика у селі Турівка Прилуцького повіту Полтавської губернії (нині належить до Київської області). Як і його брат Микола, Юрій закінчив прилуцьку чоловічу гімназію, а потім навчався на медичному факультеті Київського університету.