1888 році Іван Шишманов був одним із засновників Вищої школи (університету) Софії. З 1894 року — професор загальної літературної та культурологічної історії, а також порівняльної літературної історії. Був засновником і редактором (СбНУНК, 1889–1902), редактором журналу (1893–1900). Член Болгарської академії наук.