Тут 20 років працював дослідник і археолог Карл Казимирович Косцюшко-Валюжинич (1847—1907), перший директор музейного закладу в добу царату. З 1980 року існує під сучасною назвою. Фонди музею У фондах музею близько 200.000 експонатів з 5 ст. до н. е. до 15 ст. (понад 5000 в експозиції), серед яких: археологічні пам'ятки, епіграфічні (серед них присяги херсонесців з 3 в. до н. е., декрети на честь Діофанта, 2 ст. до н. е. тощо), колекції монет, поліхромні надгробковіі стелі (4-3 ст. до н. е.),