Однак основним джерелом забруднення є скид каналізаційних вод м. Одеси. З 1930-х років під час курортного сезону у пониззя лиману скидають стічні води зі станції біологічного очищення «Північна» м. Одеси, що призвело до зниження солоності лиману з 20-25 до 5-6 ‰. Зимою надлишок води з лиману перекочують до моря. Бальнеологічний курорт