Синцов з 1870 р. був членом Санкт-Петербурзького Мінералогічного Товариства, з 1871 р. – Товариства дослідників природи при Новоросійському університеті, з 1877 р. – Товариства любителів природознавства, антропології та етнографії при Московському університеті. За свою тривалу викладацьку діяльність Іван Федорович читав курс геології, але двічі йому довелося читати курс мінералогії. Сталося це, коли пішов з університету М. В. Єрофеєв у 1871 р., та після відставки М. О. Головкинського у 1885 р.