Одночасно він виконав велику роботу по опису колекцій Геологічного музею імені Петра Великого ІАН, перш за все, раннемелових амонітів з півострова Мангишлак, яку зібрав топограф Г. Насібянц. Музей, після смерті І. Ф. Синцова, придбав його колекції мезозойських відкладів Поволжя і третинних відкладень Бессарабії і Херсонської губернії. У 1914 р. вийшла остання палеоботанічна робота професора І. Ф. Синцова про міоценову флору Туркменістану. І. Ф. Синцов був нагороджений Орденом Св. Анни 2 ступеню та Орденом Св. Станіслава 2 ступеню.