Місто втрачає своє торгове значення і стає для османів лише стратегічним пунктом в системі оборони їх кримських володінь. Проте судацькі укріплення впали перед українськими козаками, які за наказом Богдана Хмельницького захопили місто в 1656 році. Наприкінці XVIII століття в Судацький кадалик Кафинського каймаканства входило 20 поселень від Алушти до Коз. 1783 року після російсько-турецької війни Судак у складі Криму увійшов до Російської імперії.