Уміст кисню у воді Шостки змінювався від 0,73 (8.07.1970) до 14,2 (21.10.1997) мгО2/дм³. При цьому, 18,54 % проб води мали уміст розчиненого кисню нижчий за ГДК для водойм рибогосподарського призначення (<6 мгО2/дм³), а 9,9 % проб – нижчий за граничну межу 7 категорії якості (<4 мгО2/дм³).