З 1934 р. почав роботу в Одеському держуніверситеті спочатку асистентом, а після захисту дисертації на звання кандидата біологічних наук (1935 р., керівник проф. Д. К. Третьяков) — доцентом кафедри зоології безхребетних. В 1937 р. М. П. Савчук стає професором та завідувачем кафедри, одночасно керує кафедрою філософії Одеського технологічного інституту консервної промисловості (1937—1939).