Внаслідок цього він переїхав у колиску протестантизму Віттенберг, де в 1586—1588 роках читав лекції і при своєму від'їзді виголосив гарячу похвальну промову Мартіну Лютеру. Згодом Бруно жив у Празі, Гельмштадті, Франкфурті-на-Майні і Цюриху, і в 1591 році повернувся до Італії.