На жаль, більша частина предметів була втрачена в травні 1855 року, коли вони намагалися переправити через Тигр 200 ящиків із артефактами. Під час «Інциденту в Аль-Курна» на плот напали пірати і він затонув разом з усім вантажем. У травні 1856 року під час рятувальної місії були підняті 80 ящиків і відправлені до Гавру. Інші спроби знайти втрачені артефакти із місії Френеля, включаючи японську експедицію 1971—1972 рр., були марними.