Братство було зле на Петра Могилу за те, що він організував богословську школу в Лаврі, окремо від братської. Після легалізації православної церкви у Речі Посполитій (постанова польського сейму «Про заспокоєння громадян… релігії грецької», 1632 року) уступив митрополичу кафедру Петру Могилі.