Території ПЗФ у складі МЦ Нерідко оголошенню національного парку або заповідника передує створення одного або кількох об'єктів природно-заповідного фонду місцевого значення. В результаті, великий ПЗ фактично поглинає раніше створені ПЗФ. Проте їхній статус зазвичай зберігають. До складу території природного заповідника «Михайлівська цілина» входять такі об'єкти ПЗФ України: Відділення УСПЗ «Михайлівська цілина» Заказник місцевого значення «Катеринівський», ботанічний Заказник місцевого значення «Довге», ботанічний Заказник місцевого значення «Грушевський», ботанічний Заказник місцевого значення «Лозовогрушевий», ботанічний Заказник місцевого значення «Пристайлівський», ботанічний