До 2009 року був філією Українського державного степового природного заповідника; указом президента України від 11 грудня 2009 року виокремлений у заповідник, зі збільшенням площі до 882,9 га. Про статус МЦ як окремої установи Згідно з Указом Президента України Віктора Ющенка № 1035, Кабінет Міністрів України повинен: забезпечити: вирішення питання щодо утворення адміністрації природного заповідника «Михайлівська цілина» та забезпечення її функціонування;