Геноми еукаріотичної клітини представлені: а) ядерним геномом, зосередженим у ядрі і представленим ядерною ДНК; б) у більшості клітин мітохондріальним геномом, зосередженим у мітохондріях і представленим мітохондріальною ДНК; в) у деяких клітин пластидним (зокрема, хлоропластним) геномом, що розташовується у пластиді, і представлений хлоропластною ДНК (генофором);