Лівобережна частина міста має плоский рельєф, правобережна характеризується безліччю балок і ярів, оскільки тут починається перехід до гірського рельєфу Салаїрського кряжа. До міста прилягають Заєльцовський і Кудряшівський бори, Новосибірське водосховище. Новосибірськ, як і вся Новосибірська область, знаходиться в часовому поясі Красноярський час. Зсув відносно UTC становить +7:00.