Катунь має 254 притоки загальною довжиною 708 км. У басейні Катуні налічується понад 800 льодовиків загальною площею 625 тис. км², тому льодовикове живлення Катуні грає істотну роль. Середня річна витрата води становить 600—700 м³/с. Катунь бере початок на південному схилі Катунського хребта у р. Бєлухи у льодовика Геблера.