Прісноводні екосистеми лентичні (стоячі води): озера, ставки, водосховища та ін.; лотичні (текучі води): річки, струмки, джерела та ін.; заболочені угіддя: болота, болотисті ліси, марші (приморські луки). Морські екосистеми відкритий океан (пелагічна екосистема); води континентального шельфу (прибережні води); райони апвелінгу (родючі райони з продуктивним риболовством); естуарії (прибережні бухти, протоки, гирла річок, лимани, солоні марші та ін).; глибоководні рифтові зони.