Вже 3 липня 1941 року містечко було зайняте німецькими військами. За період окупації гітлерівці розстріляли у Володимирці близько двох тисяч осіб, спалили і зруйнували десятки будинків, десятки юнаків і дівчат вивезли на примусові роботи в Німеччину. Під час Другої світової війни німецький гарнізон у містечку налічував 42 особи, з них 30 поліцаїв.