Членство в редколегіях, робочих групах, журі Ю. Шаповал член редакційних колеґій друкованих видань, таких як: «Український історичний журнал»; «Критика»; «Kyiv-Mohyla Humanities Journal»; «Вісник Харківської державної академії дизайну і мистецтв»; «З архівів ВУЧК-ГПУ-НКВД-КГБ»; «Гілея».