З промислових підприємств найбільш проблемне в плані екології — Омська ТЕЦ-5, працює на вугіллі (в той же час і на ній була проведена установка двох фільтрів очищення диму). У повітрі міста періодично виявляють діоксиди, формальдегіди і, найчастіше, бензапірен (виробляється автотранспортом). На особливому контролі у зв'язку з охороною атмосфери діяльність таких омських підприємств, як «Омскшина», «Омскагрегат» і ВО Політ.