Генеральна військова рада обирала гетьмана і вищу козацьку старшину, розглядала питання війни та миру, обговорювала зовнішньополітичні справи, а іноді й справи внутрішньої політики та судочинства. Компетенції Генеральної військової ради частково збігалися й конкурували з компетенціями гетьмана і Ради Старшини.