За винятком деяких маршрутів, метрополітен працює цілодобово, перевозячи близько чотирьох мільйонів людей на добу. У даний час почалася розробка проєкту по переведення нью-йоркського метрополітену на автоматичне управління. Вартість проїзду станом на лютий 2015 р. наступна: