В поверхневих шарах озерних відкладів на глибині 5—20 см відбуваються окислювальні процеси (гідроксилація заліза), глибоко регенеративні процеси (сульфат заліза, пірит). У Байкальській воді міститься близько 40 хімічних елементів (в дуже невеликих кількостях), більше за інших є — кальцій, вуглець, кисень, магній, натрій, калій, кремній, сірка, хлор, азот, залізо, фосфор, але є дефіцит йоду. Він володіє агресивністю і високим життєдайним особливостями для планктону та інших організмів, яких більшає з глибиною. Таким чином, усі тверді залишки тварин: звірів, риб, молюсків, швидко розкладаються, не залишаючи навіть слідів.