Чарпанак лежить біля східного берега, а острови Ахтамар і Атрек знаходяться недалеко один від одного біля південного берега озера. Недалеко від озера Ван розташовуються озера Назік (на північному заході, висота 1 870 м над рівнем моря), Ерчек (на сході, висота 1 890 м над рівнем моря) і Арін (на півночі).