У 2018 році в Музеї рідкісної книги Ніжинського державного університету імені Миколи Гоголя відкрилася Музейно-меморіальна кімната «Мандрівник козацького роду», присвячена навколосвітньому мореплавцю Ю.Ф. Лисянському. Співробітниками Ніжинського краєзнавчого музею імені І.Спаського та "Майстернею музейних проєктів Олександра Антонця" розроблено дизайн-проєкт майбутнього музею. Розроблено проєкт реставрації та пристосування під музей пам'ятки історії та архітектури місцевого значення "будинок, де народився Ю. Лисянський". На його честь названий літак авіакомпанії «Аерофлот» «Ю. Лисянский».