Після проголошення незалежності, Еритрейська православна церква відокремилася від Ефіопської і налагодила офіційні стосунки із Коптською православною церквою Єгипту. Усі еритрейські мусульмани притримуються сунітської гілки ісламу. Охорона здоров'я