На території країни налічується 33 вулкана, з яких 3 досі представляють загрозу. Найбільш відомий вулкан Агуа в 1541 році, вивергнувши з себе потоки киплячої води і бруду, знищив першу столицю Гватемали, а також вулкан Пакайя (останнє потужне виверження в 1965 році). Найбільші озера — Ісабаль, Атітлан, Петен-Іца, Аматітлан. Флора та фауна