Поряд з цивільними і шаріатськими судами в ОАЕ є система військових судів, які здійснюють юрисдикцію тільки щодо військовослужбовців. Конституція закріплює незалежність судів, проте всі судді призначаються і зміщуються виконавчою владою. На даний час всі суди знаходяться в повному і прямому підпорядкуванні міністерства юстиції федерації. Більшість суддів — іноземні громадяни, в основному з арабських країн (Єгипет, Сирія, Ліван).