Колонія розвивалася поволі, незважаючи на безжалісну експлуатацію індіанців на срібних копальнях. 1821 року Гондурас, як інші країни Центральної Америки і Мексика, проголосив свою незалежність від Іспанії, але того року ж був анексований Мексикою, де Агустін де Ітурбіде встановив режим монархії (Перша Мексиканська імперія). Федерація Центральної Америки