Міжнародні авіаперельоти здійснюють також компанії «Air Zaire», «Sabena» і інші. Аеропорт у Бужумбурі — міжнародний, у рік (2005) приймає 73 072 пасажирів, відправляє 63 908 пасажирів, відвантажений вантаж — 3 093 т, завантажений — 188 т. Є також 7 дрібніших аеропортів і один аеродром для посадки вертольотів.