Нагороджений орденом Червоного Прапора (1921). З 1953 року — персональний пенсіонер. Вшанування пам'яті У Києві в 1957–1963 роках на честь Полупанова називали вулицю Ярославів Вал, у 1963–2016 роках — вулицю Пріорську. Ім'ям Полупанова названі також вулиці в Євпаторії в Криму та в російському Ульяновську.