Підтримував політику гетьмана Івана Виговського (учасник складення Гадяцького пакту 1658 року). З обранням на гетьмана Юрія Хмельницького перейшов до нього, схилив його до союзу з Річчю Посполитою і Кримським ханством. За участі Богдановича-Зарудного був створений текст Слободищенської угоди 1660 року. У 1664 перебував на боці Павла Тетері й поляків у виступах проти гетьмана Лівобережної України Івана Брюховецького та Московського царства.