Єдиним вищим навчальним закладам є Університет Бурунді, заснований в 1960 році. Гострою проблемою в сфері освіти є недостача підготовлених викладацького й персоналу, що адмініструє. Іншою проблемою залишається дискримінація за етнічною ознакою, що виражається в перевазі представників тутсі в середніх навчальних закладах і в університеті. 1 дані на 1998 рік Інтернет