Багато країн після цього випадку зміцнили своє антитерористичне законодавство і розширили повноваження правоохоронних органів і розвідувальних служб для запобігання подібних нападів. Хоча лідер «Аль-Каїди» Осама бен Ладен спершу заперечував будь-яку причетність до теракту, 2004 року він врешті-решт узяв на себе відповідальність за атаки. Мотивами головний терорист назвав підтримку США Ізраїлю, присутність американських військ у Саудівській Аравії та санкції проти Іраку. У травні 2011 року силами американського спецпризначення SEAL Team Six Осаму бен Ладена було виявлено і вбито в Пакистані.