Для подолання цих факторів патогенні мікроорганізми мають фактори патогенності. До основних факторів патогенності належить: адгезивність () — здатність мікроорганізму закріплюватися на поверхні клітин; колонізація; інвазивність — здатність проникати та розповсюджуватися в макроорганізмі, реалізується через ферменти патогенності (гіалуронідаза, фібринолізин, нейрамінідаза, тощо); агресивність — здатність мікробів жити, розмножуватися, поширюватися в організмі та протидіяти захисним факторам організму; токсиноутворення; стійкість до дії захисних факторів макроорганізму.