Розрізняють три клінічних варіанти перебігу: обмежений і відносно стабільний, коли завдяки хіміотерапії настає певна стабілізація процесу, і загострення не відбувається упродовж кількох років; прогресуючий, що характеризується чергуванням загострень і ремісій, до того ж періоди між ними можуть бути різними — короткими і тривалими, у період загострення формуються нові ділянки запалення з утворенням нових каверн, іноді легеня може зруйнуватися повністю, у деяких хворих при неефективному лікуванні прогресуючий перебіг процесу завершується розвитком казеозної пневмонії;