Історія християнства на Руси-Україні (т. І до 1353, та т. II 1353–1458. — Рим 1965 і 1976). У працях з церковної історії М. Чубатий підкреслював значення християнства на українських землях перед Володимиром Великим, підтримував тмутороканську теорію походження ієрархії в Києві та доводив автономію і помісність Київської митрополії. Праці з історії українського права, в яких Чубатий оформив схему історії українського права