Незабаром отримав офіцерський чин. Донька Божена (1831-?) вийшла заміж за Йозефа Їречка (1825—1888), чеського історика літератури та політика, котрий певний час працював вихователем у родині Шафариків. Їхній син, історик Константин Їречек, пізніше написав книгу «Шафарик серед південних слов'ян» (Šafařík mezi Jihoslovany). Цікаві факти На честь Павла Йозефа Шафарика названо астероїд 8336 Шафарик