Ця установа була всього другим (після московського) інститутом такого профілю в країні. Вчений спочатку очолив інститут, а потім став керівником його науково-дослідного сектора. Пізніше Володимир Миколайович став завідувачем хірургічної клініки Українського інституту експериментальної медицини.