Під керівництвом В. М. Шамова обидві ці кафедри (факультетської хірургії № 1 і 2) злилися в одну, розташовану в новому приміщенні. Також саме у Харкові Володимир Миколайович організував перше в Україні нейрохірургічне відділення, експериментальну лабораторію та урологічне відділення. У цей період В. М. Шамов активно оперує, та перший в країні в 1927 році успішно проводить панкреатодуоденальну резекцію. У 1928 він розробив оригінальний метод переливання фібринозної (трупної) крові і експериментально (на собаках) довів можливість та безпечність такого виду переливання.