Вшанування пам'яті 2012 року заснована благодійна організація «Фундація Героя України, академіка П.Т. Тронька». З 2012 року ім'я академіка П.Т. Тронька носить Центр краєзнавства ХНУ імені В.Н. Каразіна. З 2013 року щорічно окремим краєзнавцям присуджується Загальноукраїнська Премія імені академіка Петра Тронька Національної спілки краєзнавців України за вагомий внесок у справу вивчення, дослідження і популяризації історико-культурних і природних багатств рідного краю у чотирьох номінаціях.