23 вересня 1492 року Ян був коронований у Кракові. Для підтримки антиосманської політики надав магнатам і шляхті привілеї на Сеймі в Пйотркові 1496 року. На конференції у Левочі () (Спіш, 1494) були узгодженні деталі походу проти Туреччини між королями Польщі і Угорщини, а також виборцем (курфюрстом) Бранденбургу Фредеріком II, із кооперацією Господаря Молдавії Стефана III, який звернувся до Яна за допомогою. Через напад татар на південь Великого князівства Литовського, епідемію хвороб у Пруссії, Руському воєводстві експедиція було відкладено.