Існує безліч шкідників, та захворювань, що уражають тютюн, зокрема — колорадський жук, тютюнова вогнівка, попелиця, тютюнова міль, трипса, бактеріальна рябуха, пестриця, пероноспороз, вірус тютюнової мозаїки, мокрий монтар та інші. Види Систематика роду Тютюн: Підрід Справжній тютюн Tabacum Nicotiana tabacum — Тютюн звичайний Nicotiana suaveolens — Тютюн запашний Підрід Сільський тютюн Rustica