Це відбулося тому, що у вищому державному та партійному керівництві взяли гору прихильники гасла «Хай живе вузька спеціалізація», і в 1930–1934 рр. КГСІ не існував. Наприкінці 1934 р. директор Київського агрохімічного інституту І. С. Миронівський домігся повернення назви «Київський сільськогосподарський інститут» та обґрунтував доцільність об'єднання голосіївських інститутів в єдину структуру, проте приєднання частини голосіївських інститутів відбулося лише у другій половині 1935 р. У роки Другої світової війни (а саме, з 1941 по 1944) КГСІ не функціонував, проте його студенти, викладачі і співробітники зробили значний внесок в оборону столиці та боротьбу з фашизмом.