Крім підготовки словникових статей Фасмер у цей час продовжував писати роботи з славістики і викладати на кафедрі (заняття велися до лютого 1945). Серед його праць цього часу: Слов'яни в Греції (, 1941), Старі взаємини населення Росії (, 1941), Грецькі запозичення в сербсько-ховатській мові (, 1944) та ін.