Цей період життя Якима має багато суперечної інформації. На початку гетьманування останнього Сомко його підтримав і взяв участь у придушенні виступу Пушкаря, однак після підписання Гадяцького договору відносини між ними не зовсім зрозумілі. Відомо про те, що Яким став противником гетьмана і, навіть, подароване шляхетство, герб та посада наказного полковника не переманили його на сторону Виговського. Отож Сомко, побоюючись за власне життя через масові репресії гетьмана проти старшини покинув Гетьманщину і відправився на Донщину.