Для збереження різноманіття флори і фауни планується створення розгалуженої мережі особливо охоронюваних природних територій (ООПТ): заповідників, національних парків, заказників, пам'яток природи. На території краю існує 51 пам'ятка природи, природний парк «Ая», Тигирекський заповідник і 35 заказників: Алеусський заказник, Бащелакський заказник, Благовещенський заказник, Бобровський заказник, Большереченський заказник, Волчихинський заказник, Єгорьєвський заказник, Єльцовський заказник, Зав'яловський заказник, Залесовський заказник, Каскад водоспадів на річці Шинок, Касмалинський заказник,