На захід від гирла розташований Ахтанізовський лиман, з'єднаний з Кубанню Козацьким Єриком, а на сході — Курчанський лиман, до якого прорито Темрюцьке гирло. З півночі та півдня до міста підходять болотисті місцевості, тому Темрюк розмістився у напрямку з північного заходу на південний схід, по берегу Курчанського лиману.