Проблема постачання води у місті та всій агломерації є важливою причиною побоювань муніципалітету: Сан-Паулу не має великих джерел води у навколишніх районах, що вимагає її постачання з віддалених районів. Проблема забруднення води особливо важлива через експансію міста, що збільшує складність постачання до найбідніших районів на периферії.