Близько 35 % населення міста щодня користуються громадським транспортом. Транспортна система міста має у своєму складі автобуси, тролейбуси, наземні і підземні швидкісні трамваї Muni Metro. Все це — так звана система San Francisco Municipal Railway (MUNI) , до складу якої також входять знамениті історичні канатні трамваї (див. Канатний трамвай Сан-Франциско).