Після ознайомлення з явищем дифракції Ньютон вніс зміни у свою гіпотезу: він постулював, що ефір трохи змінює свої властивості біля непрозорих тіл, а також частково заходить всередину таких тіл. Дифракція ж у такому випадку пояснювалася ним як особливий випадок заломлення. Неприйняття Ньютоном хвильової теорії світла пояснювалось тим, що, він вважав, що вона не могла пояснити, як біле світло розкладається на спектральні компоненти призмою, а потім може бути зібране назад у біле.