Фотій вступив у боротьбу з папою римським Миколаєм I, який вступився за скривдженого Ігнатія, що у 867 році призвело до конфлікту між римо-католицькою і православною візантійською церквами, відомого під назвою Фотієва схизма. Незабаром Фотій був усунений з патріаршого престолу новим імператором Василієм І Македонянином, який прагнув союзу з Римом. У 877–886 рр. знову титулований як Архієпископ Константинополя, Нового Риму і Вселенський Патріарх.