Місто Мюнстер знаходиться на 60 м над рівнем моря (висота виміряна на центральному ринку перед ратушею). Найближчими великими містами є Оснабрюк (44 км на північ), Дортмунд (61 км на південь), Білефельд (62 км на схід) і Енсхеде (Нідерланди) (65 км на північний захід).