19 лютого 2003 року Цюнделя депортовано у Канаду, попри те, що у нього дозвіл на перебування в Канаді вже закінчився. Канада не надала йому громадянство та відмовила у наданні притулку. У 2003 році Цюнделя було заарештовано канадською владою за запитом Німеччини, ордер на його арешт був виданий ще у 1996 році: він просидів у канадській в'язниці два роки, перш ніж був офіційно визнаний загрозою національній безпеці цієї країни, — і 24 лютого 2005 року органи канадської юстиції надали дозвіл на передачу його Німеччині, де над ним почався суд.