Учасники Собору вирішили бути «невідступними від Святої Церкви Московської». Митрополит Іона, який помер у 1461 році, був останнім митрополитом у Москві, що мав титул «Київського і всія Русі». Новий митрополит Феодосій був поставлений без дозволу й благословення Константинопольського патріарха.