Perguruan Tinggi Islam Negri ing Indonésia iku pawiyatan luhur sing dumunung ing tanggung jawab Kamentrian Agama. Ana telung jinis pawiyatan luhur sing kalebu sajeroning kategori iki, ya iku Universitas Islam Negeri (UIN), Institut Agama Islam Negeri (IAIN), lan Sekolah Tinggi Agama Islam Negeri (STAIN). Ing saben provinsi ing Indonésia ana siji UIN, IAIN, utawa STAIN.

Ing ngisor iki pratélan UIN, IAIN, lan STAIN sa Indonésia:

Universitas Islam Negri 
 Artikel utama: Universitas Islam Negeri
 UIN Alauddin, Makassar
 UIN Sulthan Syarif Qasim, Pekanbaru
 UIN Syarif Hidayatullah, Jakarta
 UIN Sunan Kalijaga, Yogyakarta
 UIN Maulana Malik Ibrahim, Malang
 UIN Sunan Gunung Djati, Bandhung

Institut Agama Islam Negri 
 Artikel utama: Institut Agama Islam Negeri
 IAIN Ar-Raniry, Bandha Acèh
 IAIN Imam Bonjol, Padhang
 IAIN Sultan Thaha Saifuddin, Jambi
 IAIN Raden Fatah, Palembang
 IAIN Raden Intan, Bandhar Lampung
 IAIN Antasari, Banjarmasin
 IAIN Sunan Ampel, Surabaya
 IAIN Walisongo, Semarang
 IAIN Mataram, Lombok NTB
 IAIN Sumatera Lor, Medan
 IAIN Syekh Nurjati, Cirebon
 IAIN Sultan Maulana Hasanuddin, Banten
 IAIN Surakarta, Surakarta
 IAIN Ambon, Ambon, Maluku
 IAIN Tulungagung, Tulungagung (Jawa Wétan)

Sekolah Tinggi Agama Islam Negri 

 STAIN Padang Sidempuan, Sihitang, Tapanuli Kidul (Sumatera Lor)
 STAIN Batusangkar, Batusangkar, Tanah Datar (Sumatera Kulon)
 STAIN Syekh M. Djamil Djambek, Bukittinggi (Sumatera Kulon)
 STAIN Kerinci, Sungai Penuh, Kerinci (Jambi)
 STAIN Curup, Rejang Lebong (Bengkulu)
 STAIN Bengkulu, Bengkulu (Bengkulu)
 STAIN Jurai Siwo Metro, Metro (Lampung)
 STAIN Syekh Abdurrahman Sidik, Sungailiat (Bangka Belitung)
 STAIN Purwokerto, Purwokerto (Jawa Tengah)
 STAIN Kudus, Kudus (Jawa Tengah)
 STAIN Salatiga, Salatiga (Jawa Tengah)
 STAIN Pekalongan, Pekalongan (Jawa Tengah)
 STAIN Ponorogo, Ponorogo (Jawa Wétan)
 STAIN Kediri, Kediri (Jawa Wétan)
 STAIN Jember, Jember (Jawa Wétan)
 STAIN Pamekasan, Pamekasan (Jawa Wétan)

 STAIN Pontianak, Pontianak (Kalimantan Kulon)
 STAIN Palangka Raya, Palangka Raya (Kalimantan Tengah)
 STAIN Sultan Sulaiman, Samarinda (Kalimantan Wétan)
 STAIN Manado, Manado (Sulawesi Lor)
 STAIN Sultan Amai, Gorontalo (Gorontalo)
 STAIN Datokarama Palu, Palu (Sulawesi Tengah)
 STAIN Watampone, Bone (Sulawesi Kidul)
 STAIN Parepare, Parepare (Sulawesi Kidul)
 STAIN Palopo, Palopo (Sulawesi Kidul)
 STAIN Sultan Qaimuddin, Kendari (Sulawesi Kidul-wétan)
 STAIN Sultan Amai, Gorontalo (Gorontalo)
 STAIN Ternate, Ternate (Maluku Lor)
 STAIN Malikussaleh, Lhokseumawe (Acèh)
 STAIN Zawiyah Cot Kala Langsa, Langsa (Acèh)

Pranala njaba 
 PTAIN Se-Indonésia

 Islam nagari ing Indonésia