Daftar perguruan tinggi swasta di Papua Pegunungan
Berikut adalah Daftar perguruan tinggi swasta di Papua Pegunungan, yang pembinaannya berada di bawah Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia dan Perguruan Tinggi Swasta Keagamaan, yang pembinaannya berada di bawah Kementerian Agama. Daftar ini tidak termasuk Perguruan Tinggi Kedinasan yang pembinaannya berada dibawah masing-masing kementerian/lembaga.

Universitas 

 Universitas Amal Ilmiah Yapis Wamena, Jayawijaya
 Universitas Okmin Papua, Pegunungan Bintang

Institut

Sekolah Tinggi 

 Sekolah Tinggi Ilmu Manajemen Informatika dan Teknik Komputer Agamua Wamena, Jayawijaya
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Petra Baliem Wamena, Jayawijaya
 Sekolah Tinggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan Abdi Wacana Wamena, Jayawijaya
 Sekolah Tinggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan Kristen Wamena, Jayawijaya

Akademi 

 Akademi Bahasa Asing Netaiken Wamena, Jayawijaya

Daftar perguruan tinggi di Indonesia