एंटीवायरस सॉफ्टवेयर को अनुप्रयोग सॉफ्टवेयर का एक रूप माना जाता है।
एक "गलत सकारात्मक" या "गलत चेतावनी" तब होता है जब एंटीवायरस सॉफ़्टवेयर एक गैर-हानिकारक फ़ाइल को मैलवेयर के रूप में पहचानता है। जब ऐसा होता है, तो यह गंभीर समस्याओं का कारण बन सकता है। उदाहरण के लिए, यदि एक एंटीवायरस प्रोग्राम को तुरंत संक्रमित फ़ाइलों को हटाने या संगरोध करने के लिए कॉन्फ़िगर किया जाता है, जैसा कि माइक्रोसॉफ्ट विंडोज एंटीवायरस अनुप्रयोगों पर आम है, तो एक आवश्यक फ़ाइल में एक गलत सकारात्मक विंडोज ऑपरेटिंग सिस्टम या कुछ अनुप्रयोगों को अनुपयोगी बना सकता है। महत्वपूर्ण सॉफ़्टवेयर बुनियादी ढांचे को इस तरह के नुकसान से उबरने के लिए तकनीकी सहायता लागत आती है और उपचारात्मक कार्रवाई करते समय व्यवसायों को बंद करने के लिए मजबूर किया जा सकता है। उदाहरण के लिए, मई 2007 में, सिमेंटेक द्वारा जारी एक दोषपूर्ण वायरस हस्ताक्षर ने गलती से आवश्यक ऑपरेटिंग सिस्टम फ़ाइलों को हटा दिया, जिससे हजारों पीसी बूट करने में असमर्थ हो गए।