ക്രോമാറ്റിൻ ഘടനയിൽ മാറ്റം വരുത്തുന്നതിലൂടെ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ നിയന്ത്രിക്കാം.
യൂക്കാരിയോട്ടുകളിൽ, ഡിഎൻഎയുടെ വലിയ പ്രദേശങ്ങളുടെ ലഭ്യത അതിന്റെ ക്രോമാറ്റിൻ ഘടനയെ ആശ്രയിച്ചിരിക്കും, ഇത് ഡിഎൻഎ മീഥൈലേഷൻ, എൻസിആർഎൻഎ, അല്ലെങ്കിൽ ഡിഎൻഎ-ബൈൻഡിംഗ് പ്രോട്ടീൻ എന്നിവ നയിക്കുന്ന ഹിസ്റ്റോൺ പരിഷ്ക്കരണങ്ങളുടെ ഫലമായി മാറ്റാൻ കഴിയും. അതിനാൽ ഈ പരിഷ്ക്കരണങ്ങൾ ഒരു ജീനിന്റെ ആവിഷ്കാരത്തെ മുകളിലേക്കോ താഴേക്കോ നിയന്ത്രിക്കാം. ജീൻ എക്സ്പ്രഷനെ നിയന്ത്രിക്കുന്ന ഈ പരിഷ്ക്കരണങ്ങളിൽ ചിലത് പാരമ്പര്യമായി ലഭിക്കുന്നവയാണ്, അവയെ എപിജെനെറ്റിക് റെഗുലേഷൻ എന്ന് വിളിക്കുന്നു.