El PPD se inició en Panamá en 2006 y, desde entonces, se han ejecutado hasta el momento más de 240 proyectos por un aproximado de USD 5.2 millones. En su gestión en Panamá, el PPD se ha centrado en trabajar con comunidades que sufren de exclusión social y que están vinculadas a altos niveles de pobreza y al trabajo con mujeres e indígenas, especialmente en zonas rurales. Se le ha dado prioridad a aquellas poblaciones que se ubican en las zonas aledañas de áreas protegidas (parques nacionales, reservas forestales e hidrológicas), cuencas y microcuencas de importancia ambiental y social, zonas marino-costeras con altos grados de biodiversidad, corredores biológicos y zonas de valor étnico cultural.
El PPD trabaja en a través de fases operacionales. A cada fase operacional le corresponde una Estrategia Nacional de País, la cual especifica los componentes, actividades e indicadores sobre los cuales se desarrollará el trabajo durante el período.