Prevalence de Mycobacterium bovis dans les agroecosystemes analyse de reservoirs environnementaux potentiels (sol, eau douce, faune du sol et faune aquatique) et tracage de la circulation de cette bacterie entre les differents compartiments
La tuberculose bovine est une maladie infectieuse contagieuse causee par Mycobacterium bovis. Cette maladie touche les bovins et de nombreuses especes de mammiferes domestiques et sauvages, ainsi que l'homme. La circulation de la bacterie dans des systemes multi hotes varies favorise l'entretien de la maladie et la contamination des bovins vivant a proximite des animaux sauvages infectes. En marge de la transmission directe de M. bovis par voie respiratoire, la transmission indirecte aux bovins, liee a l'inhalation ou a l'ingestion de matrices environnementales contaminees par un animal infecte excreteur, est suspectee dans plusieurs regions du monde. L'existence de reservoirs environnementaux ou le bacille M. bovis est capable de persister, pourrait donc etre un facteur important de la reemergence puis du maintien de la maladie dans les systemes multi hotes. En Cote d'Or, departement fortement touche par la tuberculose bovine depuis 2004, la transmission indirecte de la bacterie entre la faune sauvage infectee et les bovins est suspectee dans plusieurs elevages. Pour evaluer la presence et la survie de cette bacterie dans l'environnement, nous avons analyse un grand nombre d'echantillons preleves dans des zones partagees par les bovins et/ou la faune sauvage infectes dans le but de determiner la distribution environnementale de M. bovis. Pour ce faire, nous avons developpe ou modifie des systemes de detection moleculaire adaptes aux matrices environnementales complexes. Nous avons egalement evalue l'impact de la temperature et des proprietes physico chimiques de deux sols sur la survie de M. bovis, ainsi que le role de la mesofaune du sol (lombrics en particulier) dans la dissemination de la bacterie a partir de matiere organique contaminee. L'etude environnementale a mis plus particulierement en evidence la contamination de deux biotopes: les zones humides des patures et les sols de terriers de blaireaux. De plus, les etudes experimentales ont montre que M. bovis pouvait survivre plusieurs mois dans le sol a 4degC et que les lombrics pouvaient disseminer la bacterie dans le sol, voire jouer un role potentiel de vecteur pour les animaux qui les consomment. Ces resultats apportent de nouvelles connaissances sur la persistance et la circulation de M. bovis dans l'environnement en Cote d'Or et permettront de proposer des ameliorations aux mesures de biosecurite deja existantes dans les elevages bovins.