Phytostimulation du mais par la bacterie Azospirillum lipoferum CRT1 impact sur des communautes fonctionnelles du microbiote racinaire
Le developpement des plantes est conditionne par leurs interactions avec le microbiote racinaire, dont le fonctionnement repose sur des fonctions elementaires partagees par plusieurs taxons, au sein de groupes fonctionnels. Certains de ces groupes incluent des PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria) qui stimulent la croissance des plantes grace a differentes fonctions phytobenefiques. L'inoculation d'une PGPR peut avoir un impact sur la physiologie de la plante et sur les autres partenaires microbiens de la racine. D'ailleurs, une PGPR inoculee peut modifier la structure genetique du microbiote racinaire global, sans que l'on sache comment cet impact se concretise au niveau de groupes fonctionnels particuliers. L'hypothese de cette these est que les PGPR inoculees peuvent modifier la structure de communautes microbiennes fonctionnelles importantes pour le developpement de la plante. Ces travaux ont evalue l'impact de l'inoculation de la PGPR Azospirillum lipoferum CRT1 sur la taille et/ou la diversite des diazotrophes, des producteurs d'1 aminocyclopropane 1 carboxylate (ACC) desaminase et des producteurs de 2,4 diacetylphloroglucinol (ainsi que de la communaute bacterienne totale) dans la rhizosphere du mais cultive en champ sous differents intrants azotes. Nos travaux ont montre que diazotrophes et producteurs d'ACC desaminase pouvaient etre co selectionnes dans la rhizosphere du mais, et que l'inoculation modifiait la composition taxonomique de ces groupes fonctionnels. En conclusion, l'inoculation de PGPR module la selection rhizospherique de taxons telluriques portant des fonctions phytobenefiques, ce qui pourrait contribuer aux effets phytobenefiques observes