Representation systemique multi echelle des processus biologiques de la bacterie
La production a haut debit de donnees biologiques de nature heterogene necessite une exploitation et une integration particulieres de celles ci. Malgre le developpement de nombreuses bioontologies, l'organisation de ces donnees dans un cadre structure et adaptatif reste perfectible. Nous emettons l'hypothese qu'une approche systemique multi echelle de la representation des processus cellulaires permettrait de progresser dans cette problematique. Pour valider cette demarche, nous avons concu une modelisation ontologique des processus bacteriens necessaires a l'expression genique. Les relations entre ces processus et leurs molecules participantes ou leurs sous processus ainsi que leurs modeles ont ete formellement decrites. Cette description s'accompagne d'axiomes et de relations supplementaires sur lesquels un raisonnement automatique est effectue. La representation des processus realisee permet leur mise en relation avec leurs modeles et parametres par inference. Parallelement, le raisonnement apporte de nouvelles informations contextuelles de sequentialite, agregation ou competition. Notre contribution s'appuie sur les bio ontologies existantes pour une meilleure interoperabilite.
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