Analyse comparative de genomes complets de souches pathogenes et de portage de Staphylococcus lugdunensis et caracterisation du systeme de secretion Ess/type VII
La premiere partie de nos travaux a consiste au sequencage de genomes complets de trois souches pathogenes et de trois souches de portage de Staphylococcus lugdunensis pour les comparer aux 15 genomes complets disponibles sur NCBI. Aucun determinant genetique associe au contexte de virulence ou de portage de S. lugdunensis n'a ete identifie. Cependant, nous avons mis en evidence la presence d'elements genetiques mobiles et des variations dependantes des complexes clonaux,definis par MultiLocus Sequence Typing, au sein de loci potentiellement associes a la virulence. Des variations ont ete observees dans un locus homologue a celui de Staphylococcus aureus codant le systeme de secretion Ess/type VII (SST7) Nous avons mis en evidence huit organisations genetiques chez cette espece presentant pourtant une structure de population clonale. La seconde partie de nos travaux a consiste a la caracterisation phenotypique et moleculaire du SST7 chez S. lugdunensis par la formation d'un mutant de deletion du gene essC codant une proteine essentielle a la secretion. Nos resultats suggerent que le SST7 serait implique dans la translocation de proteines predites in silico comme impliquees dans la virulence. Neanmoins, dans des modeles de cytotoxicite cellulaire et d'infection du nematode Caenorhabditis elegans, aucune attenuation de la virulence n'a ete observee chez la souche mutante malgre une perte de sa capacite a lyser les erythrocytes, comparativement a la souche sauvage. Nos travaux ont egalement permis de developper et d'evaluer le pouvoir discriminant de trois nouvelles methodes de typage constituant des outils tres prometteurs pour l'epidemiologie moleculaire des infections a S. lugdunensis.