土御門天皇於何年登基?
建久9年
高宗任用秦檜為相。秦檜在靖康年間曾主張抗金，後被金人掠去。建炎四年十月，秦檜南返，由於他奉行投降政策，與高宗之意甚合。秦檜歸朝僅三月就成為副宰相，八月後又成為右丞相。由於秦檜大力提倡的「南自南，北自北」，當時尚與高宗相左，一年後被高宗罷免。罷相後的秦檜韜光養晦，侍機而動。紹興八年五月，高宗複任秦檜為右丞相。秦檜上臺後，迫害與自己意見不同的官員，聯姻外戚，結交內臣。高宗對於秦檜的行為採取默許。秦檜後來權勢巨大，引起高宗警覺。高宗親下命令，使秦檜的孫兒失去狀元。秦檜的權勢日漸下降。紹興廿五年，秦檜病重，策劃讓其子接替相位，被高宗否決，不久後一命嗚呼。
文永十一年，忽必烈派蒙古軍、高麗聯軍3.3萬餘人，由朝鮮半島進攻日本，元日戰爭正式爆發，史稱文永之役，不料遭遇暴風雨天氣，蒙古軍死傷慘重，罷兵回國。弘安四年1281年，忽必烈發動第二次侵日戰爭，史稱弘安之役，不料再次遇到暴風雨。蒙古的侵略，使鎌倉幕府背上了沉重的財政包袱，無力給予御家人土地和金錢上的賞賜，幕府與武士之間的關係日漸鬆懈，反抗幕府統治的實力逐漸形成。北條時賴執政時期，專制加強，家臣的御內人和被稱為外樣的一般御家人矛盾凸顯，北條時宗去世後，御內人代表平賴綱與外樣代表安達泰盛產生衝突，安達泰盛一族被全殲，史稱霜月騷動。此後，鎌倉幕府統治基礎御家人制度逐步瓦解，鎌倉幕府統治面臨崩潰。1318年，後醍醐天皇即位，決心恢復皇室權威，廢黜院政，開始親征。正中元年，後醍醐天皇密謀倒幕，但計劃被幕府得知，主要大臣遭到流放，第一次倒幕運動失敗，史稱正中之變。1331年，後醍醐天皇再次密謀倒幕，倒幕軍被幕府軍打敗，史稱元弘之亂，後醍醐天皇被流放，第二次倒幕運動失敗。元弘之亂後，近畿、東國為首的各地武士和農民的倒幕運動此起彼伏。1333年，各地豪族都開始倒幕，幕府派足利高氏前去平亂，足利高氏早已不滿北條氏專制政權，途中倒戈，攻下了鎌倉，最後一代執權北條高時自殺，鎌倉幕府滅亡。
鎌倉時代是以鎌倉為全國政治中心的武家政權時代。幕府最初實行將軍獨裁統治，三代以後權力轉歸北條氏之手。承久之亂後，北條氏的合議制執權政治達於全盛。1232年，北條泰時制訂法典御成敗式目─最初僅適用於武家內部，後來適用於全國。鎌倉政權與京都政權並存，實行二元統治。幕府通過守護、地頭掌握全國軍、警權；朝廷通過國司掌握全國一般行政權。起初勢均力敵。承久之亂後朝廷被置於幕府經常嚴密監視之下，院政有名無實，二元統治實質走向一元化。1274年、1281年在幕府執權北條時宗的領導下取得兩次反元侵略戰爭的勝利，而戰後受貨幣經濟影響，無法恩賞抗元官兵，導致御家人的貧困與御家人制度的解體。北條氏實行一族獨裁，加深御家人和非御家人武士的反感。地方武士和農民的聯合武裝團體到處進行反幕活動。幕府由盛轉衰。後醍醐天皇乘機發動正中之變與元弘之變。倒幕號召得到各地武士響應。1333年5月新田義貞攻陷鎌倉，幕府滅亡。鎌倉時代被認為是日本封建時代的開始階段，也有人認為它是日本封建制度從貴族領主制形態向武士領主制形態演變的第一階段。
建久9年1月11日，後鳥羽天皇禪位給了兒子為仁親王，是為土御門天皇。此後，後鳥羽上皇開設院政，輔佐土御門、順德、仲恭三代天皇。他積極對院政進行改革，並在1199年源賴朝死後對鐮倉幕府持強硬態度，試圖將鐮倉幕府控制在自己手裡。二代將軍源賴家被廢黜後，源千幡被後鳥羽上皇賜名「實朝」，立為鐮倉幕府第三代將軍，試圖擴大朝廷在幕府的影響力。在源實朝擔任將軍的時期，朝廷和幕府之間的關係十分親睦。幕府曾提出「宮將軍」的構想，也就是讓親王出任將軍。但實朝被暗殺後，朝廷和北條氏控制下的幕府關係惡化，後鳥羽上皇拒絕了幕府宮將軍的構想。承久元年，內裏守護源賴茂率西面武士嘩變，最終被鎮壓。其原因，一說是賴茂試圖脅迫後鳥羽上皇讓他當上將軍，另一說是要求上皇下達討幕的院宣。包括仁壽殿、宜陽殿、校書殿在內的許多宮殿被燒毀。後鳥羽上皇下令向全國徵收重建宮殿的費用，但鐮倉幕府轄下的東國地頭皆拒絕向朝廷朝貢。這使朝廷和幕府的關係急劇惡化。