東羅馬除了在軍事上面對蠻族的威脅，在宗教上也有爭論，其中最著名的是關於哪一項的爭論?
基督一性論
拜占庭帝國的軍事戰略，總體來說呈現守勢狀態。拜占庭的軍事守勢有多方面的原因，包括帝國人民對國家的認同感下滑、基督教教義的影響、帝國人口數量下降、相對於周圍民族的文化優勢等等。儘管並未沾染羅馬帝國末期重文輕武的惡習而影響來自本國人兵源，與其周邊的斯拉夫人、阿拉伯人和塞爾柱人等眾多民族相比，拜占庭人並不算極端尚武，剽悍好鬥、崇尚武力被視為粗魯無知和野蠻的表現。拜占庭帝國將軍事看作一門藝術，更重視作戰的完美性和雙方的智慧較量。早期拜占庭軍隊的主要組成部分包括邊防軍、野戰軍和駐紮於皇宮內的哥德人衛隊。邊防軍駐紮於河流和陸地邊界，服役24年；野戰軍駐紮在內地軍事要塞和交通樞紐地區，他們和皇宮衛隊需要服役20年。在帝國邊境的蠻族向帝國提供後備部隊，由皇帝直接指揮。拜占庭帝國的邊防軍採用軍區制，軍區由邊防總督指揮。6世紀時，帝國有東方、色雷斯和伊利里亞三大軍區，528年設立了亞美尼亞軍區，537年又設立了海上軍區。邊防軍士兵不再是帝國的公民兵，而是兵農合一的農兵：他們從政府那裡領取農田，自己耕種或僱人耕種，提供自給自足的軍糧，為此他們將負擔服役的義務。邊防軍和野戰軍的最基層單位為隊，每隊5人；兩隊為一連；10連為一營；4營為一團；6團為一師；3至4師組成一個軍團，一軍團即為一軍區所應提供的兵員總額。這些軍事單位同時也是兵源地的地方行政單位，某種程度上可以算是早期古羅馬帝國軍政合一的地方行政制度的復活。席哈克略皇帝時期，在帝國東部領土上普遍推廣軍區制，凡是被東羅馬人收復的土地，都建立新的塞馬州。到9世紀，在東羅馬的歐洲領土上，從愛奧尼亞群島和伊庇魯斯經馬其頓直到黑海，以及亞得里亞海濱的若干島嶼和沿海城市，普遍設立了軍區。
羅馬帝國的衰落是指羅馬帝國社會，包括政治、經濟、軍事和社會機構等的逐步瓦解和崩潰，最終使西歐遭受蠻族入侵和占據的厄運。這是《羅馬帝國衰亡史》的作者，英國歷史學家愛德華·吉朋所做的定義，但吉朋不是第一個對羅馬帝國衰落的原因和具體時間提出質疑的人。「從十八世紀起」，吉朋評論說，「我們開始沉迷於它的衰落史；我們將它捧為可知的沒落史的範本，也因此，作為我們對現實擔憂的一個象徵」。羅馬帝國的衰落已經成為最大的歷史未解之謎之一，吸引了眾多學者的興趣。1984年，德國歷史教授亞歷山大·德曼特出版的專著中列舉了前人給羅馬衰亡的210種解釋，而新的理論也從那時起紛紛被提出。羅馬帝國的衰落，標誌著古典時代的終結和歐洲中世紀的開始。大衰退約持續了320年，告終於西元476年9月4日，即西羅馬帝國皇帝羅慕路斯·奧古斯都被日耳曼將軍奧多亞塞罷黜之日，但被東羅馬帝國承認的皇帝尼波斯政權在達爾馬提亞苟延殘喘到480年。根據吉朋的評述，東羅馬帝國從此卻越來越強大，一直存在到君士坦丁堡的淪陷。關於羅馬帝國終結的標誌性時間還有：378年的阿德里安堡戰役；狄奧多西一世去世的395年，也是羅馬帝國政治統一的最後一年；日耳曼部落大規模穿越萊茵河的406年；410年，近八百年牢牢掌控在羅馬人手裡的羅馬城淪於蠻族；最後一位努力恢復西方失地的東羅馬皇帝查士丁尼一世565年的去世；632年伊斯蘭勢力的崛起。長期以來關於羅馬的衰落的理論汗牛充棟，也有關于歸根到底是不是衰落的爭論。不少學者主張與其說是衰落，不如把這個過程概括為「曲折的發展」更加確切。
麥克斯·施蒂納在他所著的《自我及所有》一書中，主張一般社會所公認的制度—包括國家的概念、「財產是一種權利」的概念、自然權利的概念、和一般對社會的概念—都只是幽靈在腦海裡作祟的幻象，主張「個人便是社會的本質」。他主張利己主義和一種形式的非道德主義，個人只有在切及他們自身利益的情況下才會聯合起來成為「利己主義者們的組織」。對他而言，財產只是由能力決定的：「知道如何去擁有它們、保護它們，那便是他的財產」並且「在我能力所及之內的，便是我的東西。只要我能顯示出自己佔有者的身分，那我便是這個東西的所有人。」施蒂納從沒有自稱他自己為無政府主義者—他只接受「利己主義者」這個稱號。不過他仍被許多人視為是無政府主義者，因為他反對國家、法律、和政府，同時他的理念也影響了許多無政府主義者，雖然對他的理念的解讀有著許多分歧。許多無政府主義者如班傑明·塔克都宣稱受了施蒂納的影響，埃瑪·戈爾德曼也在演講中宣揚他的理念。
6世紀時，東羅馬的主要敵人是幾個老對手：中古波斯地區的薩珊王朝、斯拉夫人和阿瓦爾人。神學的爭論，比如對基督一性論的爭論，也是帝國的重要話題。但東部帝國並沒有忘記它在西部的根。在查士丁尼一世和他傑出的將軍貝利薩留的領導下發動征伐亞平寧半島上的東哥特王國的歷時持續二十年的戰爭，東羅馬帝國甚至收復了它在西部喪失的部分總督區：亞平寧半島、利比亞、突尼西亞、今阿特拉斯山脈以北的阿爾及利亞和今天摩洛哥的丹吉爾和伊比利亞半島最南端。查士丁尼重編了古羅馬的法規，制定了《民法大全》。值得注意的是：這部法典是用拉丁語寫的，而當時拉丁語已被認為是一種古老的語言了，甚至許多寫這部法典的人都不太會說這種語言。530年代，在查士丁尼的統治下，聖索非亞大教堂開始動工。這座教堂後來成為東羅馬宗教生活和東正教的中心。查士丁尼一世給他的繼承人留下了一個空空的國庫，而他的繼承人也無法對付所有邊境上突然出現的新敵人。在查士丁尼時代，最早的斯拉夫人、阿瓦爾人就已經穿越了多瑙河。由於帝國的重兵集結在東部邊境，以對抗依蘭沙赫爾，因此他們得以從帝國的西北部趁虛而入。斯拉夫人打垮了駐紮在伊斯特拉半島上的帝國軍隊，並奪取了亞得里亞海沿岸的所有主要城市，摧毀了多瑙河以南的帝國防務體系。此時西班牙和義大利也面臨著蠻族起義的威脅。伊比利亞半島上的西哥特人對帝國屬地發動全面進攻，624年將羅馬的力量逐出伊比利亞半島，東哥特人隨即在義大利發動叛亂，倫巴底人於568年入侵亞平寧半島並建立了倫巴第王國，只給帝國留下亞平寧半島南端的一部分，以及拉文納與羅馬之間一塊不安全的地區。