現代大學制度的兩塊基石除了學術自由還有？
大學自治
大學自治和學術自由是現代大學制度的兩塊基石，它們解決了大學和公權力、大學和教授之間的關係。現代大學制度的實質是排斥不法干預，鼓勵教授與學生在法律許可範圍內自由、自主、自律地追求真理與探究學術，以形成大大小小的自治體。19世紀，英國國教會牛津運動領導人約翰·亨利·紐曼在《大學的理念》一書中提出了通識教育和智育是大學之本質的理念。20世紀的德國哲學家賈斯珀，首次提出了比較系統的、以存在哲學為基礎的大學理念，其最突顯之處在於強調大學應實現人的精神全面發展的整體性。二戰後的美國在大學理念上頗有建樹，雖聲調不一，但總體上是力求實現人的發展，其指導思想是現代人文主義。
自由意志主義認為他們繼承了古典自由主義。不過，一些人仍然認為兩者存在著分離、甚至互相衝突的理論。美國大法官撒母耳·佛里曼·米勒便認為：「自由意志主義只是表面上類似自由主義。自由意志主義者拒絕了自由主義所必要的制度。正確的說，自由意志主義假冒了一種觀點，而那種觀點正是自由主義依據歷史角度所反對的—那就是認為個人的政治權利處於封建制度之下。如同封建主義者，自由意志主義者構想出一種架構在個人契約連結上的政治權力。而自由主義理念所不可或缺的，便是主張政治權力乃是公眾的權力，應該公平的為公眾的利益所服務。」強調兩者間存在差異的人則主張，自由意志主義和古典自由主義間有著根本的矛盾，因自由主義裡為了檢查和平衡而使用的手段，與自由意志主義所支持的完全解除經濟管制有著衝突。
1919年5月，南京高師實施陶行知的教學法提案，以教學法代替教授法。1919年12月27日，校務會議通過陶行知提議的規定女子旁聽法案，1920年正式錄取了八名女生，為中國第一所實行男女同校的高等學校。1919年，陶行知改良課程案獲教務會議通過，學校自1920年9月實行選科制與學分制，開設必修及選修課，規定學生修畢一定學分方可畢業。陶行知的這些改革以後被教育界承認，逐步為全國教育界所採用。同時，南高與東大建立了大學自治、辦學獨立、學者治校、學生自治體制，發揚了公良學術、自由教育、學術自由、純粹學風的精神。南高東大注重實驗和研究，採用教學和研究結合，設各種研究會，各科係每一學期均有研究項目，最早在中國開展現代學術研究，建立了全國最早期的現代科學研究實驗室。國立東南大學成為中國最早的以大學自治、學術自由、文理為基本兼有農工商等專門應用科、集教學和研究於一體為特徵的現代大學，被稱為中國第一所現代大學。當時在國際上被認為是中國最好的大學；國際教育會東方部主任孟祿評價其為中國政府設立的第一所有希望的現代高等學府、中國最有發展前途的大學，將來之發達可頡頏世界最佳大學。
大學作為一種服務機構與教育研究中心，主要功能是開展教學活動、科學研究、技術開發和社會服務，提供強有力的人才保證和智力支撐，促進改革創新，推進文化傳承創新。在西方歷史上，德國哲學家康德首次提出了近代理性化大學理念，他在《學部衝突》一書中表明：「大學是一個學術共同體，它的品性是獨立追求真理和學術自由。」，為現代大學的科學探索與人文理性的結合奠定了基礎。洪堡的大學理念實際上是康德大學理念的實踐，洪堡大學創建了現代大學制度，確立了大學的教學和科研兩大職能，並把科研看作是大學的生活方式。這就是現代大學精神的一個來源，即把自由地探求未知和養成人們探求未知的習慣作為大學的生活方式。