伽利略的著作直到哪一年才從教會的禁書目錄中完全移除?
1853年
裁判庭6月22日的判決包括了3個核心部分：伽利略被判有強烈異端嫌疑，即聲稱太陽在宇宙的中心，地球不是中心而且在運動著，對持有並為此辯駁者與神聖經文相悖。他必須發誓放棄、詛咒並厭棄這樣的觀點。異端審判庭指示將他正式拘捕，第二天他將會在家中終身軟禁。他的悖逆的《對話》將被查封；在判決之外，他所有的著作將被查封，今後他不能在繼續著書。根據流行的傳奇，在宣布放棄地球圍繞太陽旋轉的理論時，伽利略曾經喃喃道但是，地球依然在轉啊，但是並沒有證據證明他是否說了類似的話。有關這個傳奇的第一個記載出現與他去世後的一個世紀左右。一段時間後，在他的朋友阿斯卡尼奧·皮科洛米尼的幫助下，伽利略於1634年被允許回到他在佛羅倫斯阿克特雷旁的小宅焦耶洛別墅，在那裡他度過了自己的餘生。伽利略被要求在三年中每星期朗讀七篇懺悔詩。他的女兒瑪利亞·塞萊斯特向教會請求，被允許將這個負擔改由她代為實行。在被軟禁在家時，伽利略致力於完成他最經典的著作之一《兩種新科學》，在此他總結了過去40年中所做的一切工作。這兩個新科學今天被叫做運動學和材料力學。此書被阿爾伯特·愛因斯坦盛讚。由於他的貢獻，伽利略被譽為現代科學之父。他於1638年完全失明，得了嚴重的疝氣和失眠，因此被准許回到佛羅倫斯接受治療。伽利略最先發現了木星的衛星。這個發現對於所有天體都必須圍繞地球轉來說並不是好消息。伽利略在1610年3月出版的《星際信使》一書中對此進行了詳細的介紹。根據一些不可靠的手稿，漢斯·利伯謝製作了第一個實用望遠鏡，並於1608年打算在荷蘭申請專利。次年，伽利略製作了一個3倍的望遠鏡，改良後，望遠鏡達到了30倍之大。通過伽利略望遠鏡，觀測者可以清晰地看到地上的豎直呈像——這便是通常所知的地面望遠鏡或小望遠鏡。伽利略也用它來進行天體觀測，在當時他是少數可以製作如此精良的觀測設備的人。1609年8月25日，他向威尼斯律師們展示了他早些時候製作的8到9倍望遠鏡。出售望遠鏡為伽利略帶來了不少的額外收入。商人們可以利用它來航海，或是作為商品交換。伽利略在1610年3月發布了他最初利用望遠鏡觀測天體的結果，題為《星際信使》。
1718年，天主教會放鬆對伽利略部份著作的禁令，允許他部份著作在佛羅倫斯印行，但是《關於托勒密和哥白尼兩大世界體系的對話》仍然遭到禁止。1741年，教宗本篤十四世授權，允許他所有在科學方面著作都能夠出版，包括經過審查修改的《對話》。1758年，天主教會將伽利略的著作由禁書目錄中移除，但是《對話》和哥白尼的《天體運行論》的一些未被審查版本仍然在名單中。直到1853年，伽利略的所有著作才從禁書目錄中被完全移除。1939年，庇護十二世在當選天主教教宗不久後，在宗教科學院發表演說，讚揚伽利略是研究方面大無畏的英雄...不怕路上的危險與絆腳石，也不懼怕到達墳墓的那一刻。教皇40年的親密顧問羅伯特·雷伯教授寫道：庇護十二世很注意不去對任何事物進行過早干預。在這點上他十分積極，並對伽利略的案件表示深深的後悔。1990年2月15日，紅衣主教約瑟夫·拉辛格在羅馬第一大學發表演說，引述了當代一些對伽利略事件的流行觀點，稱這樁案件讓我們看到了現代人對自身深深的懷疑，以及科學技術在今天的走向。他引述了哲學家保羅·費耶拉本德的一些觀點，稱在伽利略時代，教會較之伽利略本人更加理性，同時考慮了伽利略教導對未來道義和社會所產生的影響。教會對伽利略的判決是理性而公正的，對判決的否決不過是為了獲得政治利益而已。主教並沒有明確指出他同意或否認費耶拉本德的觀點。但是他說道：在此基礎上做出衝動性的道歉是愚蠢的。1992年10月31日，教宗若望·保祿二世表示教會對伽利略事件的處理方式表示遺憾，並根據宗教文化議會的研究結果，發表了一份聲明承認教會對伽利略在科學的錯誤判決。2008年3月，宗教科學院院長尼古拉·加比伯宣布計劃在梵蒂岡城牆上樹立伽利略的雕像，以示對他的紀念。同年12月，即伽利略的第一次利用望遠鏡進行觀測的400周年紀念日上，教宗本篤十六世讚揚了伽利略對天文學的貢獻。然而一個月後，宗教文化院長加弗科·拉瓦錫表示在梵蒂岡城牆上樹立伽利略雕塑被擱置了。
笛卡兒的宗教信仰在學術圈中一直被嚴格地爭論著。他聲稱是虔誠的羅馬天主教徒，以及「沉思」的目的是為了維護基督教信仰。但是在他自己的時代，笛卡兒被指控宣揚秘密的自然神論和無神論信仰。與他同時代的布萊茲·帕斯卡說，「我不能原諒笛卡兒；他在其全部的哲學之中都想能撇開上帝。然而他又不能不要上帝來輕輕碰一下，以便使世界運動起來；除此之外，他就再也用不著上帝了。」史蒂芬·高克羅格的笛卡兒傳記中寫到，「他作為一個天主教徒有著很深的宗教信仰，並一直保持到他死的那一天，並帶著堅定的，熱情的探索真理的渴望。」在笛卡兒死於瑞典後，克里斯蒂娜女王放棄了她的王位轉信羅馬天主教。她一直聯繫的僅有的天主教徒就是笛卡兒，他曾是她的個人家庭教師。
伽利略在物體運動的理論與實驗上成果豐碩，並與克卜勒和勒內·笛卡爾一道，成為艾薩克·牛頓爵士所創立的經典物理的先驅。伽利略試製了幾個鐘擺實驗。這些實驗的靈感據傳說是來自於觀察比薩大教堂中央銅質吊燈的擺動，並測算伽利略自己的脈搏而得到的。這些實驗日後被記載在他的著作《兩種新科學》中。伽利略認為簡單的鐘擺是等時的，即無論幅度多大，擺的周期運動時長總是一定的。然而，根據克里斯蒂·惠更斯的研究，這只是近似成立，並不精確。伽利略發現了周期的乘方與鐘擺的長度成比。伽利略的兒子文森佐根據他父親的理論與1642年設計了一個大鐘。但大鐘沒能夠建造起來，主要是因為擺度太大，需要冕狀司行輪，導致計時不准。伽利略在理解聲音頻率上也是先驅之一，雖然他在這點上並不是很出名。伽利略在以不同的速度摩擦鑿子時，發現了鑿子中間距的不同導致了音高的不同，即頻率的不同。1638年，伽利略描述了測量光速的實驗：安排兩個人站在一定遠的距離，各拿著帶百葉窗的燈籠。第一個觀測者打開燈籠的百葉，第二個觀測者看到後，立即打開他手上的燈籠百葉。這樣，從第一個觀測者開燈到第二個觀測者開燈之間時差就可以用來計算光在兩者之間穿越所需要的時間。伽利略報告說，他在相距一英里之內做過這樣的實驗，但是無法確定光是否是同時出現的。在伽利略去世後，佛倫丁地西門托科學院的院士們也嘗試了類似的實驗，實驗距離超過了一英里，但直到1667年，也以無果告終。伽利略總結了相對論的基本原理，即物理定律在任意系統內一定，沿直線勻速運動的物體，無論它的具體速度還是方向，物理定律一定。如此看來，不存在絕對運動或是絕對靜止。這條原理為牛頓定律提供了基本框架，它也是愛因斯坦狹義相對論的核心部分。