多醣要如何轉接到蛋白質？
在寡醣鏈轉移酶的作用下
呼吸道的上皮細胞會分泌許多可以保護肺部的物質，包括分泌型免疫球蛋白、膠原凝集素、防禦素、肽和蛋白酶，活性氧和活性氮等都是由上皮細胞產生的。這些分泌物可以做為抗菌劑，使呼吸道不會受到感染。呼吸道的上皮細胞也會分泌趨化因子及細胞因子，使得傳統的免疫細胞可以到受感染的部位。呼吸系統中大部份都包覆了由黏膜組成的淋巴樣組織，會產生像淋巴細胞等白細胞。肺部除了進行氣體交換外，也有許多代謝和內分泌上的機能。肺部會產生表面活性劑，也有可以溶解肺血管血栓的纖維蛋白溶解系統。肺部會分泌許多物質，由動脈送到全身，也會從去除血管中的一些物質。在血液循環時，前列腺素會減少甚至消失，但當肺組織伸展時，肺部會合成前列腺素，釋放到血液中。
澱粉、蛋白質和纖維素等大分子多聚體不能很快被細胞所吸收，需要先被分解為小分子單體然後才能被用於細胞代謝。有多種消化性酶能夠降解這些多聚體，如蛋白酶可以將但蛋白質降解為多肽片斷或胺基酸，糖苷水解酶可以將多醣分解為單醣。微生物只是簡單地分泌消化性酶到周圍環境中，而動物則只能由其消化系統中的特定細胞來分泌這些酶。由這些位於細胞外的酶分解獲得的胺基酸或單醣接著通過主動運輸蛋白被運送到細胞內。胺基酸既可以被用於合成蛋白質或其他生物分子，又可以被氧化為尿素和二氧化碳以提供能量。氧化的第一步是由轉氨酶將胺基酸上的胺基除去，胺基隨後被送入尿素循環，而留下的脫去胺基的碳骨架以酮酸的形式存在。有多種酮酸是檸檬酸循環的中間物。此外，生糖胺基酸能夠通過葡萄糖新生作用被轉化為葡萄糖。
合成代謝是一系列合成型代謝進程的總稱。一般而言，用於組成細胞結構的複雜分子都是從小且簡單的前體一步一步地構建而來。合成代謝包括三個基本階段：首先生成前體分子，如胺基酸、單醣、類異戊二烯和核苷酸；其次，利用三磷酸腺苷水解所提供的能量，這些分子被活化而形成活性形式；最後，它們被組裝成複雜的分子，如蛋白質、多醣、脂類和核酸。不同的生物體所需要合成的各類複雜分子也互不相同。自營生物，如植物，可以在細胞中利用簡單的小分子，如二氧化碳和水，來合成複雜的有機分子如多醣和蛋白質。異營生物則需要更複雜的物質來源，如單醣和胺基酸，來生產對應的複雜分子。生物體還可以根據它們所獲得的能量來源的不同而被細分為：獲取光能的光能自營生物和光能異營生物，以及從無機物氧化過程或的能量的化能自營生物和化能異營生物。
雖然脂肪是通用的儲存能量的方式，但在脊椎動物，如人類中，儲存的脂肪酸不能通過葡萄糖新生作用而被轉化為葡萄糖，因為這些生物體無法將乙醯輔酶轉變為丙酮酸鹽。因此，在長期飢餓後，脊椎動物需要從脂肪酸來製造酮體來代替組織中的葡萄糖，因為像腦這樣的組織不能夠代謝脂肪酸。在其它生物體，如植物和細菌中，由於存在乙醛酸循環，可以跳過檸檬酸循環中的脫羧反應，使得乙醯輔酶可以被轉化為草醯乙酸鹽，而草醯乙酸鹽可以被用於葡萄糖的生產，因此解決了脊椎動物中存在的這一代謝問題。多醣和聚糖是通過逐步加入單醣來合成的，加入單醣的過程是由糖基轉移酶將糖基從一個活化的糖-磷酸供體上轉移到作為受體的羥基上。由於糖環上的任一羥基都可以作為受體，因此多醣鏈可以是直鏈結構，也可以含有多個支鏈。這些生成的多醣自身可以具有結構或代謝功能，或者可以在寡醣鏈轉移酶的作用下被轉接到脂類和蛋白質上。